作者koodoozoo (直到累倒才認輸)
看板Biotech
標題[討論] RAPD的polymerase選擇
時間Thu Nov 13 02:38:38 2008
我們實驗室是用F牌的taq polymerase
昨天我要做第二次的check的時候，發現舊的用完了，冰箱也沒庫存了
我只好換了一個不同的taq polymerase來用
結果~~~除了最明顯的條帶是相同的，其他都不ㄧ樣
而我要找的差異條帶也不見了~Q Q
我自己覺得雖然都是taq polymerase，但PCR產物的量差很多
其中一個號稱效果比較好的dream taq簡直就是亮到刺眼的程度
而且產物都集中在2000 ~3000bp
請問各位大大，taq polymerase對RAPD的再現性有這麼大的影響嗎
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 140.120.240.148
1F：→ sGoat:光是PCR用不同家的Taq都會有很大差異了... 11/13 08:24
2F：推 fc01:有PAPER講過,RAPD就算條件和操作者一模一樣,再現性大約只有 11/13 11:04
3F：→ fc01:86.6%,其他RFLP,microsatellite,AFLP都是100%左右 11/13 11:05
4F：→ fc01:而且,RAPD超過2000bp的條帶基本上不可信,沒什麼再現性 11/13 11:06
5F：推 dankai:每家的Taq跑出來的條帶都不ㄧ樣~~像我用Takara的條帶集中在 11/13 12:00
6F：→ dankai:2000多~~~如果用便宜一點的super-therm就會出現在1000上下 11/13 12:01
7F：→ dankai:再現性說真的不高~我今天作換給學弟作後...結果可能就不ㄧ 11/13 12:02
8F：→ dankai:樣了~~~ 變因超多!!@@ 我們老闆拿著過去學姐做的一直叫我們 11/13 12:03
9F：→ dankai:學妹做出ㄧ模ㄧ樣的...唉!!! 原PO你如果選定ㄧ個taq就固定 11/13 12:05
10F：→ dankai:不然RAPD以他再現性而言...會玩死你!!! 11/13 12:06
11F：→ koodoozoo:謝謝大家的回答~~感恩 11/13 23:34