作者koodoozoo (直到累倒才认输)
看板Biotech
标题[讨论] RAPD的polymerase选择
时间Thu Nov 13 02:38:38 2008
我们实验室是用F牌的taq polymerase
昨天我要做第二次的check的时候，发现旧的用完了，冰箱也没库存了
我只好换了一个不同的taq polymerase来用
结果~~~除了最明显的条带是相同的，其他都不ㄧ样
而我要找的差异条带也不见了~Q Q
我自己觉得虽然都是taq polymerase，但PCR产物的量差很多
其中一个号称效果比较好的dream taq简直就是亮到刺眼的程度
而且产物都集中在2000 ~3000bp
请问各位大大，taq polymerase对RAPD的再现性有这麽大的影响吗
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.120.240.148
1F：→ sGoat:光是PCR用不同家的Taq都会有很大差异了... 11/13 08:24
2F：推 fc01:有PAPER讲过,RAPD就算条件和操作者一模一样,再现性大约只有 11/13 11:04
3F：→ fc01:86.6%,其他RFLP,microsatellite,AFLP都是100%左右 11/13 11:05
4F：→ fc01:而且,RAPD超过2000bp的条带基本上不可信,没什麽再现性 11/13 11:06
5F：推 dankai:每家的Taq跑出来的条带都不ㄧ样~~像我用Takara的条带集中在 11/13 12:00
6F：→ dankai:2000多~~~如果用便宜一点的super-therm就会出现在1000上下 11/13 12:01
7F：→ dankai:再现性说真的不高~我今天作换给学弟作後...结果可能就不ㄧ 11/13 12:02
8F：→ dankai:样了~~~ 变因超多!!@@ 我们老板拿着过去学姐做的一直叫我们 11/13 12:03
9F：→ dankai:学妹做出ㄧ模ㄧ样的...唉!!! 原PO你如果选定ㄧ个taq就固定 11/13 12:05
10F：→ dankai:不然RAPD以他再现性而言...会玩死你!!! 11/13 12:06
11F：→ koodoozoo:谢谢大家的回答~~感恩 11/13 23:34