作者bicon (不以物喜不以己悲)
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標題[討論] 請問EtBr與核酸
時間Thu Oct 30 12:26:59 2008
請問大家
我學到的知識告訴我,EtBr會鑲嵌到DNA的雙股結構
Q1:所以 EtBr只會染雙股?
那PCR時 run gel 時,染過EtBr後,膠最下面會有淡淡的一團 應該是primer
Q2:primer應該是單股,所以EtBr可以染到單股?
或是染到的是已經由單股anneal成雙股 or dimer?
Q3:RNA也可以run gel,為什麼單股RNA可以染到?
或是 染到的是已經有2nd 結構的RNA?
很基本的問題,但是不太清楚,想問大家,謝謝
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im a good student
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◆ From: 140.129.77.7
※ 編輯: bicon 來自: 140.129.77.7 (10/30 12:29)
※ 編輯: bicon 來自: 140.129.77.7 (10/30 12:33)
1F:推 tsubasawolfy:1.Primer dimer 2.RNA secondary structure 10/30 13:02
2F:推 sGoat:雖然說是鑲嵌,但是還是基於親水舒水親和力的關係 10/30 13:31
3F:→ sGoat:可以wiki一下EtBr的結構,有解釋到某些部位會跟疏水區域親合 10/30 13:32
4F:→ sGoat: 疏水(第一行打錯 10/30 13:32
5F:推 hann7526:搭順風車問一下 那RNA跑變性電泳還是可以用EtBr染 10/30 15:03
6F:→ hann7526:可是變性之後還會有secondary structure嗎 謝謝>< 10/30 15:03
7F:推 sharkcell:RNA在變性電泳後依舊可用EtBr染色,並非全部靠2nd結構 10/30 18:03
8F:→ sharkcell:來使RNA被EtBr染色 10/30 18:03
9F:推 linda0410:想順道請問一下 primer之間沒有互補關係 如何形成dimer 11/01 00:43
10F:推 sGoat:簡單說要是兩個片段上都有GCGC這種連續的片段就會有dimer 11/01 12:16
11F:→ sGoat:不需要完全互補,連續3個鹼基就會互粘... 11/01 12:17
12F:推 linda0410:了解哩 謝謝^^ 11/03 11:53