作者bicon (不以物喜不以己悲)
看板Biotech
标题[讨论] 请问EtBr与核酸
时间Thu Oct 30 12:26:59 2008
请问大家
我学到的知识告诉我,EtBr会镶嵌到DNA的双股结构
Q1:所以 EtBr只会染双股?
那PCR时 run gel 时,染过EtBr後,胶最下面会有淡淡的一团 应该是primer
Q2:primer应该是单股,所以EtBr可以染到单股?
或是染到的是已经由单股anneal成双股 or dimer?
Q3:RNA也可以run gel,为什麽单股RNA可以染到?
或是 染到的是已经有2nd 结构的RNA?
很基本的问题,但是不太清楚,想问大家,谢谢
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im a good student
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◆ From: 140.129.77.7
※ 编辑: bicon 来自: 140.129.77.7 (10/30 12:29)
※ 编辑: bicon 来自: 140.129.77.7 (10/30 12:33)
1F:推 tsubasawolfy:1.Primer dimer 2.RNA secondary structure 10/30 13:02
2F:推 sGoat:虽然说是镶嵌,但是还是基於亲水舒水亲和力的关系 10/30 13:31
3F:→ sGoat:可以wiki一下EtBr的结构,有解释到某些部位会跟疏水区域亲合 10/30 13:32
4F:→ sGoat: 疏水(第一行打错 10/30 13:32
5F:推 hann7526:搭顺风车问一下 那RNA跑变性电泳还是可以用EtBr染 10/30 15:03
6F:→ hann7526:可是变性之後还会有secondary structure吗 谢谢>< 10/30 15:03
7F:推 sharkcell:RNA在变性电泳後依旧可用EtBr染色,并非全部靠2nd结构 10/30 18:03
8F:→ sharkcell:来使RNA被EtBr染色 10/30 18:03
9F:推 linda0410:想顺道请问一下 primer之间没有互补关系 如何形成dimer 11/01 00:43
10F:推 sGoat:简单说要是两个片段上都有GCGC这种连续的片段就会有dimer 11/01 12:16
11F:→ sGoat:不需要完全互补,连续3个硷基就会互粘... 11/01 12:17
12F:推 linda0410:了解哩 谢谢^^ 11/03 11:53