作者stool (要死了)
看板Biotech
標題Re: [求救] 有沒有這種軟體 關於protein structure
時間Mon Oct 13 14:53:58 2008
※ 引述《stool (要死了)》之銘言：
: 你輸入amino acid sequence
: 然後它幫你做protein structure的預測
: 請問有這種軟體嗎? 最好是線上的更方便
: 因為我的論文主要是研究
: 在S-HDAg一個amino acid改變 得到一些phenotype的原因
: 有在猜是protein structure造成
: 想先看看能不能用軟體預測
: 如果有的話請告訴我 謝謝:)
另外想請問 這個protein是可以形成dimer的
能不能predict這個AA change是否會影響dimer的形成?
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 140.112.133.215
1F：→ lingon:要用structural modeling 去推測單一AA substitution 10/13 19:04
2F：→ lingon:造成對dimeric interface interaction的影響... 10/13 19:05
3F：→ lingon:除非這蛋白已經有solved的co-crystal structure, 那你可以 10/13 19:08
4F：→ lingon:用rosetta去算single mutation的delta G,如果連monomeric 10/13 19:09
5F：推 lingon:都是計算出來的, 那整體的計算準確度會令人懷疑 10/13 19:13
6F：→ sportsman:Discovery Studio軟體中的ZDOCK模組可解決這個問題 10/22 02:23