作者stool (要死了)
看板Biotech
标题Re: [求救] 有没有这种软体 关於protein structure
时间Mon Oct 13 14:53:58 2008
※ 引述《stool (要死了)》之铭言：
: 你输入amino acid sequence
: 然後它帮你做protein structure的预测
: 请问有这种软体吗? 最好是线上的更方便
: 因为我的论文主要是研究
: 在S-HDAg一个amino acid改变 得到一些phenotype的原因
: 有在猜是protein structure造成
: 想先看看能不能用软体预测
: 如果有的话请告诉我 谢谢:)
另外想请问 这个protein是可以形成dimer的
能不能predict这个AA change是否会影响dimer的形成?
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.112.133.215
1F：→ lingon:要用structural modeling 去推测单一AA substitution 10/13 19:04
2F：→ lingon:造成对dimeric interface interaction的影响... 10/13 19:05
3F：→ lingon:除非这蛋白已经有solved的co-crystal structure, 那你可以 10/13 19:08
4F：→ lingon:用rosetta去算single mutation的delta G,如果连monomeric 10/13 19:09
5F：推 lingon:都是计算出来的, 那整体的计算准确度会令人怀疑 10/13 19:13
6F：→ sportsman:Discovery Studio软体中的ZDOCK模组可解决这个问题 10/22 02:23