作者veltine (Time go by~~~)
看板Biotech
標題Re: [求救] 使用pET-29載體進行ligation
時間Sat Aug 30 04:12:17 2008
※ 引述《bbiioo (梅子)》之銘言:
: 最近一個約1.5kb的片刻要表現
: 是用pET-29進行Ligation
: 切位是 NdeI & XhoI
: 我是兩種酵素同時去切,再接
: 轉形後!!
: 也有長出菌株
: 可是抽出的質體
: 我再用酵素cleavage確定有沒接上
: 可是...就是切不出我要的(size不對...)
: 問的結果說是可能當初就沒切好
: 不然就是沒接上
: 想請問...到底可能是哪裡出問題了??
: 是不是一定要分開切??
: 麻煩大家幫我一下了!!謝謝
(1)設計具有酵素切位的primer,請上NEB網頁上的Cleavage Close to the End of DNA
Fragments查詢,除了加入酵素切位序列外,記得還要多加1個或2個以上的
base pair,以利酵素進行切割。(我猜的理由:讓酵素有地方bind進行切割)
(2)double digestion,依據每個實驗室使用酵素的不同,可以上網查查該公司的網
頁或是catalog,上面會有double digestion table,假如使用double digestion
請digest overnight。(幫你查過了,假如是NEB-buffer 4或是fermentas-Buffer O
這兩個酵素可以同時下去切)
(3)也幫你看過pET-29 vector,兩個切位很遠,所以可以切的開。(假如你的vector沒有被modified)
(4)不知道你是什麼酵素進行check?假如你是用設計primer的Ndel和XhoI切的話,
片段不對,代表你PCR沒amplify你的target gene,請重新確認你的PCR產物。
(5)不一定要分開切,但是分開切效果會比一起切好,只是你需要再多花時間。
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