作者homer0331 (Homer)
站內Biotech
標題[求救] real-time primer 設計
時間Tue Jul 15 10:27:20 2008
我對於Q-PCR的接觸只有幾次而已，
但是老師要我做Q-PCR的相對定量比較
最近一直卡在primer這關
一直都在最一開始測condition時就發現很不專一的情形。
由於之前學姊都用beacon designer設計primer
但是現在學校授權沒了，
無法比對2級結構。
所以我用taqman設計，
但是一設計就好多，
不太知道哪個是合適的primer。
而且beacon會作物種比對，taqman好像沒有
所以我想請問大家都怎麼設計的
還是說用一般的設計軟體就好?
我在網路上有看到primerbank這個網站，
不知它提供的primer專一度高不高?
請大家幫我解惑，謝謝。
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 140.121.179.203
1F：推 qqo8855436:去 ncbi 做 blast 07/15 21:47
2F：推 meiosisLin:RTprimerDB可以直接找到已知有的序列可用 07/16 00:08
3F：→ meiosisLin:要看二級結構，羅式ABI軟體都可參考 07/16 00:09
4F：→ meiosisLin:專一性的問題在道ncbi做blast....三個步驟一起跑. 07/16 00:10