作者homer0331 (Homer)
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标题[求救] real-time primer 设计
时间Tue Jul 15 10:27:20 2008
我对於Q-PCR的接触只有几次而已，
但是老师要我做Q-PCR的相对定量比较
最近一直卡在primer这关
一直都在最一开始测condition时就发现很不专一的情形。
由於之前学姊都用beacon designer设计primer
但是现在学校授权没了，
无法比对2级结构。
所以我用taqman设计，
但是一设计就好多，
不太知道哪个是合适的primer。
而且beacon会作物种比对，taqman好像没有
所以我想请问大家都怎麽设计的
还是说用一般的设计软体就好?
我在网路上有看到primerbank这个网站，
不知它提供的primer专一度高不高?
请大家帮我解惑，谢谢。
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.121.179.203
1F：推 qqo8855436:去 ncbi 做 blast 07/15 21:47
2F：推 meiosisLin:RTprimerDB可以直接找到已知有的序列可用 07/16 00:08
3F：→ meiosisLin:要看二级结构，罗式ABI软体都可参考 07/16 00:09
4F：→ meiosisLin:专一性的问题在道ncbi做blast....三个步骤一起跑. 07/16 00:10