作者plokij5668 (在微笑中 我想我可以很好)
看板Biotech
標題[求救] 設計primer需要用到ESTs的比對嗎？？
時間Wed Oct 17 12:02:25 2007
目前我想針對一個蛋白設計出他的primer
那我先找出他的amino acid seq後
需要把他轉成CDS嗎
然後..如果在NCBI上就已經找得到這個蛋白的mRNA seq
我是要用CDS 的還是用原本那個mRNA seq
（有點混亂）
然後..ESTs的功用是什麼？？
設計primer需要用到這個database嗎
對不起阿...我真的很混亂..
希望大家幫個忙..
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 123.240.136.150
1F：推 HIbaby:你設計primer的目的是? 如果要表現全長蛋白質 就看CDS 10/17 12:08
2F：推 HIbaby:如果要RT-PCR 則mRNA序列合適的地方都可以. 10/17 12:09
3F：推 HIbaby:NCBI mRNA上的資訊 旁邊就有CDS是從哪裡到哪裡的資訊 10/17 12:12
4F：推 plokij5668:我是要看這個蛋白的mRNA在那個時期會表現 10/17 15:14
5F：推 HIbaby:那應該做RT-PCR或是northern就可以了, mRNA上的序列都可用 10/17 15:23
6F：推 HIbaby:但是不見得要全長 RT-PCR 兩三百到是挺適合 10/17 15:23
7F：推 plokij5668:那我是不是要避開isoform的地方呢？？ 10/17 15:45
8F：推 HIbaby:恩 如果選擇的區域 最好有他的獨特性 10/17 15:52
9F：推 plokij5668:嗯嗯！！謝謝你阿！！如果有問題可以再麻煩你嗎？？ 10/17 16:10
10F：推 HIbaby:貼在板上應該很多大大都可以一起討論喔 10/17 16:21