作者plokij5668 (在微笑中 我想我可以很好)
看板Biotech
标题[求救] 设计primer需要用到ESTs的比对吗？？
时间Wed Oct 17 12:02:25 2007
目前我想针对一个蛋白设计出他的primer
那我先找出他的amino acid seq後
需要把他转成CDS吗
然後..如果在NCBI上就已经找得到这个蛋白的mRNA seq
我是要用CDS 的还是用原本那个mRNA seq
（有点混乱）
然後..ESTs的功用是什麽？？
设计primer需要用到这个database吗
对不起阿...我真的很混乱..
希望大家帮个忙..
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 123.240.136.150
1F：推 HIbaby:你设计primer的目的是? 如果要表现全长蛋白质 就看CDS 10/17 12:08
2F：推 HIbaby:如果要RT-PCR 则mRNA序列合适的地方都可以. 10/17 12:09
3F：推 HIbaby:NCBI mRNA上的资讯 旁边就有CDS是从哪里到哪里的资讯 10/17 12:12
4F：推 plokij5668:我是要看这个蛋白的mRNA在那个时期会表现 10/17 15:14
5F：推 HIbaby:那应该做RT-PCR或是northern就可以了, mRNA上的序列都可用 10/17 15:23
6F：推 HIbaby:但是不见得要全长 RT-PCR 两三百到是挺适合 10/17 15:23
7F：推 plokij5668:那我是不是要避开isoform的地方呢？？ 10/17 15:45
8F：推 HIbaby:恩 如果选择的区域 最好有他的独特性 10/17 15:52
9F：推 plokij5668:嗯嗯！！谢谢你阿！！如果有问题可以再麻烦你吗？？ 10/17 16:10
10F：推 HIbaby:贴在板上应该很多大大都可以一起讨论喔 10/17 16:21