※ 引述《bluecsky (我要藍藍淡淡的天空)》之銘言： : 最近在跑SDS-PAGE有一些疑惑 : 我知道SDS-PAGE所跑出的是denature的狀態的protein : 所以跑出的位置是protein被denature的狀態下的分子量..應該對吧 : 所以這有沒有可能表示... : 這跟我用軟體計算的原本分子量(一般計算應該都是算native的吧) : 這之中是有誤差的..可能大或是小.. : 所以這麼說的話..跑SDS-PAGE使用protein marker不就相當沒有意義嗎? : 因為跟本無法得知是否是真確的 : 有請高手幫我解惑.. 使用軟體計算出的分子量在不管醣化或是其他post-modification的作用下... 所得的分子量是正確的... 跑SDS-PAGE使用marker的意義在於幫助你找到蛋白可能出現的位置... 並不是說膠上所對應的位置就一定是某蛋白... 也不能確認是否有其他分子量相同的雜蛋白出現在該位置... 唯一去確認的方式是作identification... 不管是mass或是NMR... 就像是你某個實驗控制到一定的精準程度後... 你不用跑marker也會知道蛋白會出現在哪...不是嗎... 當然你也不能確定你的蛋白有100% denature... 而PAGE的解析受限於shape以及mass... 當然在準確度上就有盲點... --

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