※ 引述《bluecsky (我要蓝蓝淡淡的天空)》之铭言： : 最近在跑SDS-PAGE有一些疑惑 : 我知道SDS-PAGE所跑出的是denature的状态的protein : 所以跑出的位置是protein被denature的状态下的分子量..应该对吧 : 所以这有没有可能表示... : 这跟我用软体计算的原本分子量(一般计算应该都是算native的吧) : 这之中是有误差的..可能大或是小.. : 所以这麽说的话..跑SDS-PAGE使用protein marker不就相当没有意义吗? : 因为跟本无法得知是否是真确的 : 有请高手帮我解惑.. 使用软体计算出的分子量在不管醣化或是其他post-modification的作用下... 所得的分子量是正确的... 跑SDS-PAGE使用marker的意义在於帮助你找到蛋白可能出现的位置... 并不是说胶上所对应的位置就一定是某蛋白... 也不能确认是否有其他分子量相同的杂蛋白出现在该位置... 唯一去确认的方式是作identification... 不管是mass或是NMR... 就像是你某个实验控制到一定的精准程度後... 你不用跑marker也会知道蛋白会出现在哪...不是吗... 当然你也不能确定你的蛋白有100% denature... 而PAGE的解析受限於shape以及mass... 当然在准确度上就有盲点... --

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