作者ronall (暱稱小公主的!扣十分先)
看板Biotech
標題Re: [問題] 什麼時候用NMR什麼時候用X-ray解結構？
時間Sun Sep 9 17:17:31 2007
就我所知的說一夏
我是化學所的生化組
我做的是蛋白研究
理論上而言
我盡可能希望獲的蛋白的NMR圖譜
因為NMR適用於水溶液的環境
對於bio而言
這點是非常重要的關鍵
因為僅有在這樣的條件下
才能說是看見蛋白在生物體中的真實結構
而X-Ray
在檢測前有個前提
就是必須養晶
無論是哪種蛋白
通常在養晶時必須加入一些重金屬作為晶核
或是與蛋白敖合形成晶種
即便有不加入重金屬而養晶的方式
都無法比NMR方式肯定的說
這是在生物體中較為真實的存在結構
但NMR檢測也是有缺點的
就是必須相較於X-Ray而言
必須要有相當程度的濃度才能檢測
而通常
我們盡可能使用N label (N同位素標定)的方式檢測
但是硬是要養出被同位素標記的蛋白通常都是不容易的
因為是屬於強迫性的方式供給菌種極為少量的養分
迫使菌種吸收同位素生產蛋白
因此產率通常都很低
此外
蛋白是種大型分子
因此通常低磁場的NMR圖譜是不能看的
在我的實驗室中
都是送到我學校的NMR 600MHz 貴儀中心進行2D NMR檢測
(國內學校單位有這樣的機型的不多見)
而X-Ray在樣品的製作上是容易的許多
解析通常也不錯
但是唯一為人所詬病的就是
這樣的結構並不是存在於水溶液環境底下的
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耶 (十字架)▕ 實┌───────┐(講台上) 耶穌問正在seminar的我
蘇 ● ▕ 驗│ ︿囧︿ │
耶穌：小鬼，你混哪的？怎麼
的 ▔耶▔ ▕ 室│ 我 │
比我被釘的還慘....？
信 ∥ ╭──╮▕ 的└── ╱╲ ──┘╭──╮ 我 ：主啊，我是研究所新生
徒 ╭│偉大│▕ 人 ╔═══╗╭─│去死│
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◆ From: 140.120.9.11
1F：推 Highwind:有疑問,膜蛋白呢?真正free的蛋白質並不多呀 09/09 17:50
2F：推 vixen:NMR與養晶的濃度通常都很高啊(>1mg/ml) 09/09 22:22
3F：推 timbrian:這篇文章硬要說嚴謹度不太夠 09/09 22:57
4F：→ timbrian:很明顯的對X-ray 解結構有些錯誤的認知.. 09/09 22:59
※ 編輯: ronall 來自: 140.120.9.11 (09/10 00:08)
5F：→ ronall:抱歉~我所指的濃度是指養出NMR用15N label的難度(用詞不確) 09/10 00:15
6F：→ ronall:用詞不夠精確~這邊確實是我的疏忽ˊˋ 09/10 00:16