作者ronall (昵称小公主的!扣十分先)
看板Biotech
标题Re: [问题] 什麽时候用NMR什麽时候用X-ray解结构？
时间Sun Sep 9 17:17:31 2007
就我所知的说一夏
我是化学所的生化组
我做的是蛋白研究
理论上而言
我尽可能希望获的蛋白的NMR图谱
因为NMR适用於水溶液的环境
对於bio而言
这点是非常重要的关键
因为仅有在这样的条件下
才能说是看见蛋白在生物体中的真实结构
而X-Ray
在检测前有个前提
就是必须养晶
无论是哪种蛋白
通常在养晶时必须加入一些重金属作为晶核
或是与蛋白敖合形成晶种
即便有不加入重金属而养晶的方式
都无法比NMR方式肯定的说
这是在生物体中较为真实的存在结构
但NMR检测也是有缺点的
就是必须相较於X-Ray而言
必须要有相当程度的浓度才能检测
而通常
我们尽可能使用N label (N同位素标定)的方式检测
但是硬是要养出被同位素标记的蛋白通常都是不容易的
因为是属於强迫性的方式供给菌种极为少量的养分
迫使菌种吸收同位素生产蛋白
因此产率通常都很低
此外
蛋白是种大型分子
因此通常低磁场的NMR图谱是不能看的
在我的实验室中
都是送到我学校的NMR 600MHz 贵仪中心进行2D NMR检测
(国内学校单位有这样的机型的不多见)
而X-Ray在样品的制作上是容易的许多
解析通常也不错
但是唯一为人所诟病的就是
这样的结构并不是存在於水溶液环境底下的
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耶 (十字架)▕ 实┌───────┐(讲台上) 耶稣问正在seminar的我
苏 ● ▕ 验│ ︿囧︿ │
耶稣：小鬼，你混哪的？怎麽
的 ▔耶▔ ▕ 室│ 我 │
比我被钉的还惨....？
信 ∥ ╭──╮▕ 的└── ╱╲ ──┘╭──╮ 我 ：主啊，我是研究所新生
徒 ╭│伟大│▕ 人 ╔═══╗╭─│去死│
们=> ○●○●╰──╯▕ 们=> ○●○●○● ╰──╯ www.wretch.cc/album/ronall
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◆ From: 140.120.9.11
1F：推 Highwind:有疑问,膜蛋白呢?真正free的蛋白质并不多呀 09/09 17:50
2F：推 vixen:NMR与养晶的浓度通常都很高啊(>1mg/ml) 09/09 22:22
3F：推 timbrian:这篇文章硬要说严谨度不太够 09/09 22:57
4F：→ timbrian:很明显的对X-ray 解结构有些错误的认知.. 09/09 22:59
※ 编辑: ronall 来自: 140.120.9.11 (09/10 00:08)
5F：→ ronall:抱歉~我所指的浓度是指养出NMR用15N label的难度(用词不确) 09/10 00:15
6F：→ ronall:用词不够精确~这边确实是我的疏忽ˊˋ 09/10 00:16