作者rebredoxin (工作中...)
看板Biotech
標題Re: [問題] 什麼時候用NMR什麼時候用X-ray解結構？
時間Fri Sep 7 10:42:47 2007
※ 引述《VVVVii (aa)》之銘言：
: 請問一下解結構時
: 什麼情況下要用NMR
: 什麼情況要用X-ray呢？
: ==
: 我沒修過相關的課，這也不是作業
基本上，只要抓的到老鼠的（解的出結構）的都是好貓。
硬要分的話，大概以200個residue為一個模糊的界線吧，
NMR較適用於解小蛋白質的結構，很少看過超過200 redidue的。
這個跟NMR圖譜的解析程度有關，residue數目太多訊號會疊在一起很難解。
X-ray就沒有這個問題了，只要晶體長的出來，resolution夠好一般都可以解出來。
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 140.114.45.186
1F：推 elgase:意思是X-ray的解析度比NMR好? 09/07 11:14
2F：→ aggaci:記得老師說過醣蛋白不能用X-ray 09/07 12:30
3F：推 rebredoxin:我對醣蛋白不熟，不過據我所知醣蛋白大部分是 09/07 13:30
4F：→ rebredoxin:membrane protein 結晶很困難，另外醣類分子的構形比 09/07 13:31
5F：→ rebredoxin:protein多太多了，要得到漂亮的晶體也不容易。 09/07 13:33
6F：→ rebredoxin:回e大，NMR並沒有解析度這個參數，所以也不能這麼說 09/07 13:35
7F：→ rebredoxin:NMR與X-ray各有優缺點，結構生物學的書會比較。 09/07 13:36
8F：推 rebredoxin:NMR與X-ray各有一套評估解出結構的標準，基本上只要能 09/07 13:50
9F：→ rebredoxin:被RCSB PDB databank收進去的都結構沒什麼問題> 09/07 13:51
10F：推 ermine:X-ray並非晶體長的出來且解析度夠好就能解的出結構... 09/07 19:59
11F：推 MaiKTV:去化學版問 會得到較多的回答 09/07 23:51
12F：→ MaiKTV:X ray來看 alpha helix較佳 NMR則是看 beta sheet較好 09/07 23:53
13F：→ MaiKTV:但NMR頂多只能看50kDa以下的蛋白 看不到disulfide bond 09/07 23:54
14F：→ MaiKTV:在晶體養的好的前提下 用XRD是首選 因為它只能看結構 09/07 23:56
15F：→ MaiKTV:卻解的很不錯 而NMR功能較廣 在生物分子上還能看dynamics 09/07 23:57
16F：推 elgase:感謝各位的回答<(_ _)> 09/08 11:54