作者rebredoxin (工作中...)
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标题Re: [问题] 什麽时候用NMR什麽时候用X-ray解结构？
时间Fri Sep 7 10:42:47 2007
※ 引述《VVVVii (aa)》之铭言：
: 请问一下解结构时
: 什麽情况下要用NMR
: 什麽情况要用X-ray呢？
: ==
: 我没修过相关的课，这也不是作业
基本上，只要抓的到老鼠的（解的出结构）的都是好猫。
硬要分的话，大概以200个residue为一个模糊的界线吧，
NMR较适用於解小蛋白质的结构，很少看过超过200 redidue的。
这个跟NMR图谱的解析程度有关，residue数目太多讯号会叠在一起很难解。
X-ray就没有这个问题了，只要晶体长的出来，resolution够好一般都可以解出来。
--
※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.114.45.186
1F：推 elgase:意思是X-ray的解析度比NMR好? 09/07 11:14
2F：→ aggaci:记得老师说过醣蛋白不能用X-ray 09/07 12:30
3F：推 rebredoxin:我对醣蛋白不熟，不过据我所知醣蛋白大部分是 09/07 13:30
4F：→ rebredoxin:membrane protein 结晶很困难，另外醣类分子的构形比 09/07 13:31
5F：→ rebredoxin:protein多太多了，要得到漂亮的晶体也不容易。 09/07 13:33
6F：→ rebredoxin:回e大，NMR并没有解析度这个参数，所以也不能这麽说 09/07 13:35
7F：→ rebredoxin:NMR与X-ray各有优缺点，结构生物学的书会比较。 09/07 13:36
8F：推 rebredoxin:NMR与X-ray各有一套评估解出结构的标准，基本上只要能 09/07 13:50
9F：→ rebredoxin:被RCSB PDB databank收进去的都结构没什麽问题> 09/07 13:51
10F：推 ermine:X-ray并非晶体长的出来且解析度够好就能解的出结构... 09/07 19:59
11F：推 MaiKTV:去化学版问 会得到较多的回答 09/07 23:51
12F：→ MaiKTV:X ray来看 alpha helix较佳 NMR则是看 beta sheet较好 09/07 23:53
13F：→ MaiKTV:但NMR顶多只能看50kDa以下的蛋白 看不到disulfide bond 09/07 23:54
14F：→ MaiKTV:在晶体养的好的前提下 用XRD是首选 因为它只能看结构 09/07 23:56
15F：→ MaiKTV:却解的很不错 而NMR功能较广 在生物分子上还能看dynamics 09/07 23:57
16F：推 elgase:感谢各位的回答<(_ _)> 09/08 11:54