作者cutebetty (Qb)
看板Biotech
標題[問題] 如何尋找轉錄因子未知的DNA結合位
時間Thu Jun 28 10:25:46 2007
請教各位
如果今天我找到ㄧ個轉錄因子 但是不知道他調控的基因是哪一個
我希望能先找到此蛋白結合的promoter 再從database中找它調控的基因
目前我想到的方式是利用ChIP的方法 找到結合的DNA
但一般的ChIP都是利用已知的primer將DNA PCR放大
那結合上此蛋白的未知DNA我要如何將它選殖出來呢?
如果使用random primer是否可行?
亦或是有其它的方法可以得到這段DNA
希望有做過這方面實驗的版友能提供一點資訊
感激不盡......
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 140.129.77.130
1F：推 aggaci:Search ChIP-chip 06/28 12:54
2F：推 jwencmc:先去看看有沒有人發表這個轉錄因子的結構之類的 07/02 15:35
3F：→ jwencmc:然後看看這個轉錄因子有沒有某些motif 07/02 15:35
4F：→ jwencmc:跟其他的轉錄因子一樣...... 07/02 15:36
5F：→ jwencmc:去推測以後...可以做Ch-ip...EMSA..footprint... 07/02 15:36
6F：→ jwencmc:甚至是promoter assay 07/02 15:37