作者cutebetty (Qb)
看板Biotech
标题[问题] 如何寻找转录因子未知的DNA结合位
时间Thu Jun 28 10:25:46 2007
请教各位
如果今天我找到ㄧ个转录因子 但是不知道他调控的基因是哪一个
我希望能先找到此蛋白结合的promoter 再从database中找它调控的基因
目前我想到的方式是利用ChIP的方法 找到结合的DNA
但一般的ChIP都是利用已知的primer将DNA PCR放大
那结合上此蛋白的未知DNA我要如何将它选殖出来呢?
如果使用random primer是否可行?
亦或是有其它的方法可以得到这段DNA
希望有做过这方面实验的版友能提供一点资讯
感激不尽......
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.129.77.130
1F：推 aggaci:Search ChIP-chip 06/28 12:54
2F：推 jwencmc:先去看看有没有人发表这个转录因子的结构之类的 07/02 15:35
3F：→ jwencmc:然後看看这个转录因子有没有某些motif 07/02 15:35
4F：→ jwencmc:跟其他的转录因子一样...... 07/02 15:36
5F：→ jwencmc:去推测以後...可以做Ch-ip...EMSA..footprint... 07/02 15:36
6F：→ jwencmc:甚至是promoter assay 07/02 15:37