作者paua (waiting for good news)
看板Biotech
標題Re: [問題] 病毒論文的實驗
時間Sun Apr 16 02:47:22 2006
非常感謝您肯花這麼多時間幫我看原文, 還有用心回答 :)
我還有一個問題想請教您, 麻煩您了 :P
實驗中分別使用ICP0 viral promoter及integrated ICP0 promoter的vector和plasmid,
transfect到細胞中, 之後再用HSV-1感染並觀察NF-kB被吸引到哪些promoter上.
我的問題是, fig5A (
http://tinyurl.com/jsy48)的圖片介紹提到:
上面那個是ICP0 viral promoter, 下面的是intergrated viral promoter,
(箭頭所指的方向代表primer的位置). 但我不懂, 為什麼這樣序列的安排稱作
ICP0 viral promoter及intergrated viral promoter?
我完全不曉得要從哪裡去瞭解它, 是否可以麻煩請您給我一些指引呢?
* fig 5 :
http://tinyurl.com/ghkat
※ 引述《blence ( )》之銘言:
: Herpes simplex virus disrupts NF-κB regulation by blocking its recruitment
: on the IκBα promoter and directing the factor on viral genes
: 從文章標題知道,HSV阻斷NFKB的能力(活化IKB)
: 是利用病毒本身的基因(ICP0)將細胞內的NFKB全部吸引過來
: Viral ICP0 Promoter Shows Remarkable Avidity for NF-kB
: 這部分的實驗在說明病毒的基因能吸附NFKB
: 是病毒本身的ICP0 promoter (ICP0p)幹的
: 所以實驗先證明NFKB可以結合在病毒ICP0p與IKBp上(一開始,第1時間點)
: 第2時間點時,NFKB只結合在病毒的ICP0p上
: (那是不是病毒對於ICP0p的親和力比IKBp高?) 不是
: 因為如果把ICP0p弄到stably integrated cells(HaCaT-ICP0-Luc)
: 即把ICP0p放到跟IKBp一樣都在染色體上,NFKB對於這兩個就都不喜歡了
: 在這時候NFKB還是比較喜歡在病毒基因上,自由自在的ICP0p
: 而不是被染色體包覆的ICP0p或IKBp
: 因此作者推測HSV的感染,引發染色質chromatin全面性的改變或修飾
: 使得原本IKB promoter可以讓NFKB結合的位置變得難以靠近
: (而HSV也順勢將無處可歸的NFKB抓到自己的ICP0 promoter上面來)
--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 140.129.60.111
1F:推 blence:請參考CHIP:chromatin immunoprecipitation,了解這實驗方法 04/16 13:45
2F:→ blence:應該就很懂為什麼有F-a的兩對primer及c-e的實驗結果的意義 04/16 13:46