作者Fongshin (微笑曲线)
看板Biotech
标题Re: [求救] 有人做microRNA的吗?
时间Thu Jan 7 21:17:37 2016
我这阵子也有在接触miRNA,不过真的不是很明了,因为实验室的一部分计画有接触人体
试验,当初是先收病患血液後,送去做
次世代定序(Next Generation Sequencing, NGS),分析出来的data,再利用学校的IPA
生物路径分享软体生物资料库,去做分析(这部分我只上了一堂教育训练,还是听不懂)
利用这软体抓取相关的 基因序列(?)
Paper也会有写序列调控哪些部分、相关
,因当初这部分不是我做的,所以没法清楚的告诉你,很抱歉
一般会使用的网路资源还有 miRBase
(
http://www.mirbase.org/) 里面会有你需要的序列,也会有相关性,不过听业务说里面
大多为human和mouse,另外,ABI 自己後来有一个TagMan的资料库,里面还包含rat可用
的部分
由於我们实验室也是才开始做这些部分,所以抽取miRNA都是使用Qiagen 的试剂(以前是
诺贝尔公司独家代理,现在原厂自己开立公司为凯杰)我现在使用上有问题会跟他们请教
,当然也有很多公司可以问,只是刚开始还是会想问大厂的,不过Qiagen试剂不便宜,mi
RNA用的也没有大包装可以买,刚开始可以先试看看,不过之後可以试着用小厂自己去合
成需要的primer序列,除非你们实验室很有钱.........
进阶、凯杰、ABI(应该是并在莱富 invitrogen)
生工、基龙米克斯...等都可以问看看,最近跟我们有接触的还有研毅公司
另外那个NGS的部分,之前实验室接洽的是 威健生技公司,你都可以打电话询问看看
我只有这一点点小资讯,希望可以帮到你的忙
※ 引述《whatupmen (jia)》之铭言:
: 最近教授与医院合作
: 开始接触miRNA
: 只是有个问题
: paper里的miRNAxxx
: 是如何找到?
: 还是用已知序列去设计
: 然後乱枪打鸟这样?
: 还是有一套的sop ?
: 请做过miRNA大大 指点迷津一下
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1F:→ Fongshin: 欸,写了一大堆才发现我不是回作者信箱啊...01/07 21:20
※ 编辑: Fongshin (59.115.135.156), 01/07/2016 21:20:35
2F:推 honey823: 推 资讯分享 01/07 23:12
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4F:→ Fongshin: 有收到创世纪公司业务的来信,感谢他提供的资讯,贵公司 01/08 12:43
5F:→ Fongshin: 也有相关资讯和产品可以试用和询问,自己实验室不是很 01/08 12:43
6F:→ Fongshin: 有钱,所以也只是先求不出错和稳定,之後也会试着使用 01/08 12:43
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