作者Ianthegood (杂碎。)
看板Biotech
标题Re: [求救] 请问基因定序
时间Thu Oct 24 16:42:19 2013
阿弄资料弄的好累来回一下好了
※ 引述《evana28 (烦)》之铭言:
: 各位好
: 我不是生技相关背景出身的
: 最近被老板指派研究基因定序相关的产业
: 问的问题可能很粗浅
: 但请求各位的帮助
: 问题一:基因定序最终的目的是什麽?
: 就我目前在网路搜寻的结果,是把DNA片段的"AGCT"编码顺序找出来吗?
: 那找出来之後,可以做什麽呢?
好的你要先了解所有的生物都是按照一个蓝图去打造 不是凭空蹦出来的
这个蓝图叫做你的染色体
里面的最小单元就是四种硷基 ATCG
那这个蓝图很大 非常非常大
整个染色体跟ATCG的关系大概就像是(GTA5+上古卷轴)^2跟000111的关系吧
好回来你的问题
定序的目的是什麽呢???
简单来说有两种
一是正向的你要去设计某个东西来做实验
二是逆向的你想知道这个东西是怎麽会这样的
一就像是你要写出GTA里面的树叶好了
二就像是你想破解整个GTA的游戏码
: 问题二:台湾有很多做基因定序服务的公司,例如基隆米克斯、明欣..等等
: 这些公司存在的意义是什麽? 基因定序的工作不能研究单位自己在实验室完成吗?
: 另外,每一家基因定序服务的公司做的东西有差别吗?
: 我以为是仪器买来资料输入,资料就会自动输出了
: 所以只要有钱买仪器,就可以开一家基因定序服务的公司了吗?
: 基因定序服务的好跟坏,判别的标准是什麽?
定序一开始都是在自己实验室做的
因为步骤很繁杂 还要跑很大张很长的毛细管胶(这是在我踏入这个领域之前了~"~)
自从有了机器全自动化之後这个现象就变了
当然你还是可以自己用老的方式定
也可以买机器自己定
就像同样的你也可以买机器做面条跟自己揉馒头压面条一样
好的接下来每家定序服务有差别吗?
有
就算每家的机器都用一样
每个操作员用的设定都会不同
上机的操作有些眉眉角角的东西
价钱 还有更重要的 品质
都会不同
并不是很单纯的A -> B这样
如果是的话 那很多不愿意降价的公司不都不用活了
只要有钱买机器就可以开定序公司了吗?
甚至不用
台湾现在也有公司是接了单之後全部把sample寄去中国上机的
然後还削价竞争
所以服贸大家真的要小心阿(菸)
定序的好坏判定是什麽
好这是一个相当主观的东西
可能有的sample结构机器不好解
读出来讯号不好
可能你的sample本来就有杂讯
可能这家公司一次读不好
你就觉得这家公司很烂
可能有的sample这家公司解的出来 那家公司就不行
而且又有时候你的sample很珍贵
不想给定序公司浪费的时候
嗯
所以这麽多公司才都活的下去咩
: 问题三:引子合成又是什麽东西?
: 看到很多做基因定序服务的公司,都会有引子合成这项业务,这是什麽?
: 不知道问的问题对不对
: 如果问的方式错了还请包含
: 另外能不能用比较浅显易懂的方式说明呢
: 网路上搜寻到的资料都很专业,我实在看的雾煞煞
: 如果有人可以回答的话
: 真的非常感谢
引子是什麽呢
好的 你要定出一段序列需要有个标记
不然机器不知道要从哪里开始读
这个标记就是引子
其实就是一小段的DNA序列
会跟序列互补的DNA黏在一起
然後机器就知道要从这里开始读
为什麽定序公司通常都也有引子合成业务呢?
因为要定序一定要primer阿
让你花钱一次花完就好
省的东跑西跑 他还少赚一票
如果东西有问题 自己公司里也比较好处理吧
还有就是会卖定序机的厂商都有出oligo合成机
大概一起买有打折吧...
我比较想问原po是做什麽的?
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1F:推 kaikai1112:产业研究的吧 10/24 16:46