作者god0430 (016)
看板Biotech
标题[求救] 有关site-directed mutagenesis
时间Fri Dec 16 01:36:47 2011
发问时请注意,若是要问实验相关的问题,请将实验的步骤、所用的条件大致列出
以方便板友帮您追踪问题
----请将上列注意事项以 ctrl + k 删除後开始编辑文章----
板上各位前辈大家晚安~~~
小弟最近在作site-directed mutagenesis
但是一直遇到个问题....
跑完PCR後 会用Dpn 1在37度下切个一小时
然後跑Agarose Gel 确认一下大小~
跑出来的结果在预期的地方(6K)看不到band??
但是在1K那却有Band??
这..到底是发生了什麽事??
是PCR没有作到我要放大的基因吗??
还是primer乱黏??
这样我还需要transformation到DH-5 alpha吗??
(感觉作了也长不出colony....~"~)
(小弟用的vector是pET30(约6K左右);promoter是T7 promoter)
附上小弟的PCR的材料...
5uL 10xpfu buffer
1uL Primer Forward
1uL Primer Reverse
5uL dNTP(因为放-20度C有点时间了~所以想说多加一点)
15uL Plasmid(因为浓度有点低~所以才多放一点@@)
22uL dd-water(灭过菌的)
1uL pfu polymerase
------------------------------------------------------
Total 50uL
PCR的condition如下....
95度C Pre-heating
95度C 30秒
55度C 1分钟
68度C 10分钟(看protocol是写1kb/mins)
共12cycle~
不知道板上的前辈们能不能给晚辈我一点建议...
或是有哪个步骤作错了
(少加什麽?或不该加什麽?)
恳请给予小弟指导~~
拜托大家了 > <
谢谢~~~~~~
--
※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.113.63.243
1F:推 dodomilk:请把浓度也附上,另外12 cycle不会太少吗? 12/16 11:16
2F:→ dodomilk:你确定P出来的是1K吗? 还是primer dimer? 12/16 11:17
3F:推 wensing:图? 12/16 11:34
4F:推 lyu0001:primer length and Tm? 12/16 13:22
5F:推 vedali:TM时间用30秒就可了吧? 68度?不用72度跑6分钟就好吧? 12/16 15:41
6F:→ vedali:12cycle太少了25比较好 12/16 15:41
7F:推 mandible:我觉得要看到很难ㄟ..坐坐看transformation吧!! 12/16 15:52
8F:推 nhxcyge:总template量建议小於50ng,然後跑20-25个cycles看看 12/16 18:06
9F:→ nhxcyge:Quikchange的product量较少,在DNA gel上不一定看得到产物 12/16 18:07