作者huuban (冰酒瓶子)
看板Biotech
标题Re: [求救] 用旧的agarose gel跑RNA
时间Sat Nov 12 18:14:05 2011
真的要抓问题的话
每个环节都可以挑一挑..当然我不是说到处都是问题
只是强调每个环节都很重要
还有一点要确定的
就是到底有没有关心到真正的问题在哪里
※ 引述《rockerwei (才女)》之铭言:
: ※ 引述《rockerwei (才女)》之铭言:
: : 再求救一次~我这次已经用新的buffer跑了~可是还是没有18S和28S的band
也有听说有的物种本来就只有一条
不一定都会有这两条
我们就有样本总共要有7条
: : 我在想是不是配胶的问题
: : 因为我是直接拿DNA的agarose gel来跑
有没有污染啊,说不定边跑边degrade
胶的浓度是多少呢?会不会跑不动?会不会时间不够?是不是跳海了?
: : 请问大大们
: : 有没有配RNA gel 的配方~~
有,而且有很多种
从这里开始
: 整个流程就是抽完RNA然後我拿5ul去跑胶
重点是loading多少量 (RNA的总重 ex : 0.5-1 ug)
不是体积
因为我们不知道你的比值有多少 (比值会影响浓度的正确性)
也不知道你用的浓度
可能 5 ul太稀,那当然跑不出东西
请确定 :
1.你的RNA为无色透明
2.比值及浓度
再拿来讨论
: 大概是100v
跟电压无关,50v也可以跑
: 抽RNA的流程就是用组织研磨器加上Tri-zol(3ml)放在50ml的tube里面打碎
什麽组织?多少组织?有没有超出reagent容许范围?
别人也是这样抽有成功吗?
如果有成功案例才拿来讨论,否则请看protocol
说不定reagent根本跟样本不合啊
: 再加入1ml的chloroform~然後votex再分装到eppendorf里面~
chloroform的体积依原始protocol应该是600ul吧 (抱歉应该我不清楚调体积会如何
: 等五分钟~在离心12000rpm 10 min
: 离心後取上清液
: 加入isopropanol等30min
: 离心12000rpm 30min
: 用DEPC-EtOH wash 离心12000rpm 10min
: 吸乾酒精~加DEPC-H2O
: 然後就测浓度~跑胶~~~
: 我真的不知道发生什麽问题
如果是针对跑胶的问题
拿别人抽的确定品质 OK 的 RNA 来一起跑,或是跑单股 RNA marker
如果失败了就是跑胶出问题
如果 marker 或是标准品 OK 但你的样本挂掉,那就是制备上的问题
很简单吧 :)
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