作者MrCAKE (Keep Working)
看板Biotech
标题[闲聊] 跑电泳经验分享
时间Wed Nov 24 15:53:58 2010
看到版上有人问抽DNA、RNA及跑电泳的问题 在此抛砖引玉一下
我不是啥强者 只是一般量产型的硕士生 板上很多强者应该可以狂电我
不过跑过的胶也有接近千片 可以小小分享一下电泳的经验
因为已经毕业两年多了 对实验的印象有点馍糊 有错误的地方也请鞭小力点XD
我比较擅长的是抽菇类gDNA
抽大量(300ug-1mg)时用传统方法 sample数多但只需小量时用kit抽
不过我的实验材料用传统方法抽起来品质较好 所以以下的图都是用传统方法抽的
我的sample含有很多醣类 所以没纯化乾净的话跑起来会很丑
http://www.wretch.cc/album/show.php?i=MrCAKE&b=2&f=1285630546&p=0
相对的 状况较好时 就算一次loading很多也OK
http://www.wretch.cc/album/show.php?i=MrCAKE&b=2&f=1285630547&p=1
在gDNA旁的marker通常只是为了预测浓度 大小是不准的
(要知道gDNA的确实大小要跑PFGE)
而plasmid的大小在没切成linear前也不准
(图中是约20-40kb的cosmid,一般KIT或传统方法抽起来都差不多)
http://www.wretch.cc/album/show.php?i=MrCAKE&b=2&f=1285630549&p=2
跑plasmid或较大片段的PCR amplicon时要用1-10K或更大的marker
(图中为5.7k及3.7K的PCR产物)
http://www.wretch.cc/album/show.php?i=MrCAKE&b=2&f=1285630550&p=3
RNA变性电泳(这张图是try浓度时跑的,不过要注意,由於pipette的误差,
loading到0.5ul以下时的浓度是不可信赖的,不管哪个牌子的pipette都一样)
http://www.wretch.cc/album/show.php?i=MrCAKE&b=2&f=1285630551&p=4
RNA也可以用一般非变性的DNA gel来跑
http://www.wretch.cc/album/show.php?i=MrCAKE&b=2&f=1285630552&p=5
跑大量sample时,多插几排comb可以省时间也省钱(不过前提为片段大小不用太精准)
http://www.wretch.cc/album/show.php?i=MrCAKE&b=2&f=1285630553&p=6
如果不想用polyacrylamide gel,较高解析度的agarose在适当条件下也可以分离
仅差10bp以下的片段
http://www.wretch.cc/album/show.php?i=MrCAKE&b=2&f=1285630554&p=7
没有marker可用时 我都会自制marker......
http://www.wretch.cc/album/show.php?i=MrCAKE&b=2&f=1285630555&p=8
最後 送给大家这张图
http://www.wretch.cc/album/show.php?i=MrCAKE&b=2&f=1285630556&p=9
实验不可能永远不失败 但是痛苦过後还是要继续撑下去
(我也曾经同一个实验卡住一年半 每天看结果只想骂干)
做不出来多问问有经验的学长姐或其他实验室的人 会比自己乱try有效很多
不排斥的话可以上国外论坛爬文
http://www.protocol-online.org/forums/
http://molecularbiology.forums.biotechniques.com/
这是我最常用的两个 有关实验技巧的资料非常丰富 几乎都能找到解答
而且外国学者都很nice 所以我後来也注册了帐号 有不懂的就去上面问问题XD
希望这篇文章能够帮助到一些人~
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 124.8.75.189
※ 编辑: MrCAKE 来自: 124.8.75.189 (11/24 15:55)
1F:推 david6602ok:香菇? 蘑菇? 灵芝? 很酷的说 11/24 16:30
2F:→ MrCAKE:主要是灵芝。 牛樟芝、其他菇类或真菌也有 11/24 16:38
3F:→ MrCAKE:其他相簿里的菇类照片是采集时照的 不是用来做实验的~~~ 11/24 16:42
4F:推 forWinds:我好爱菇类喔 雨季最大的乐趣就是找菇 11/24 22:09