作者wangba (原来...)
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标题Re: [求救] 请问vector与insert序列中皆有ATG?
时间Sat May 1 04:49:31 2010
※ 引述《yp (熊皮)》之铭言:
: 请问各位先进
: 目前有一vector cloning site之前有设计一组ATG,
: 而手边要使用的insert 其起始序列也含有ATG,
: 接入之後 经过计算 此两个ATG是不同的frame.
: 1. 请问这时的蛋白质表现是会为何? (仅有vector的 仅有insert的 还是皆有?)
: Insert的部份能够表现出预期的蛋白质吗?
: 2. 若是不行的话 请问各位有何建议?
: 如:需重设计引子 然後使用vector的ATG?
: 换掉vector? (由於实验限制 这点暂不考虑)
: .........
如果是我 我的作法是拿掉Vector上的ATG
毕竟利用Vector上的ATG会多出几个amino acid
并不是原来的序列
至於说要如何拿掉呢
我用图示来说明好了
EcoRI V
BamHI I
GAATTC ---ATG---
GGATCC--ATG---
===>digest with EcoRI and BamHI
===>run gel to remove Vector's ATG
===>klenow fill in and ligase
===>
GAATTGATCC--ATG
当然 这里的 EcoRI 和 BamHI只是举例
如果没有适合的cutting site
同样的方法也可以改在inser上 使其in frame
比如说
V BamHI I
ATG CA
GGATCC ATG
===>digest with BamHI
===>klenow fill in and linase
===>
ATG CA
G GAT C GA TCC ATG
同样地 这里的BamHI也只是举例
要注意的是klenow只能补齐5'突出的cutting site
像是3'突出的KpnI就不能用这方法
只能用nuclease digest的方法
同时如图示 一次多几个base是由突出几个base决定的
除了klenow之外 也可以用polymerase补齐
至於如何使用klenow就要参照使用说明 不在这篇的讨论范围
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◆ From: 140.112.129.9
1F:→ ranilla:kpn I就把3'吃完而已,还是可用吧 05/01 11:03
2F:推 yp:谢谢回答 另请问若没拿掉时 insert蛋白质也能够顺利表现吗? 05/01 14:29
3F:→ sheepfeather:原原PO的问题...想成是一般的Met就很好理解罗 05/01 14:57