作者tsubasawolfy (悠久の翼)
看板Biotech
标题Re: [求救]请问PCR products用restriction enzymeꐠ…
时间Thu Aug 14 11:22:01 2008
※ 引述《calmato (Anita~)》之铭言:
: ※ 引述《albertwang (会思考的鱼)》之铭言:
: 不好意思~因为我是第一次接触分生~很多东西都是自己try
: 或找资料或问人~所以有很多东西~不知该怎麽问或该注意什麽
: ~所以真的很不好意思~遇到很多问题却自己一直没法解决 >"<
: 厂商给的information 是只有说 To make 100uM stock solution
: add 255 ul of buffer
: 我的working primer是从这里面取10ul primer + 90 ul water
: 那我把我的所有try的条件po上来~但不知道这样是不是您说的反应条件?
: 跑PCR ,total volume 30,water 19.85,primer Forward and reverse
: 各1,10x dNTP 3,10xPCR buffer 3 ,Taq 0.15 ,Template DNA 2
: 以上单位都是ul。但我的DNA浓度品质不一~OD从 40~800 ng/ul
: 使用restrition enzyme: PCR products 5,water 16.4,10x Buffer 2
: 50X SAM 0.6,enzyme 1;total volume 25,使用的厂牌是Fermentas
: 它的protocal是PCR reaction mixture 10ul(~0.1-0.5ug of DNA)
: water 18 ,10X Buffer Tango 2,50XSAM 0.6,enzyme 1-2
: 因为考量到我的PCR products加10会切不完整,~所以才加5,但照我的想法
: 我的DNA量不算太少,切出来应该会很清楚,但不知为何拍出来照片都很淡
: 我一直找不出原因。
: 也想请问您刚说用酒精沉淀,是如何做呢?
: 以上很冗长,感谢您的指教!!
PCR完的product要clean up後测OD才准吧...不然你也只会测到一堆primer
如果直接拿去切...你所说的100bp以下也有可能是primer dimer
所以就是要先把primer 先去除後再考虑你说的问题
所以呢 应该有两个方法
1.用PCR purification kit 去除primer buffer Tagpolymerase
因为会有loss 所以做PCR的时候可以多做几管(clean up顺便浓缩)
2.直接跑电泳 然後把你要的band切下来做Gel degestion分离出你要的片段
这方法会比第一个loss更多(取决於你切的胶量, kit品质)
只是可以更直接确定你纯化出来的是你要的产物
之後的产物再拿去做你的PCR check应该会更有准确性
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◆ From: 163.15.174.69