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标 题Re: [问题] protein marker以及SDS-PAGE的band
发信站清华生命科学 BBS (Sun Oct 7 23:39:26 2007)
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不是修饰与否的问题
当然蛋白质的後修饰会造成理论值跟实际值的差异
但是原 po 问的是SDS 跑出来的结果是否 "几乎必然" 跟计算不同
原 po 所持的理由是
"计算出来的是 native form 的分子量"
但
"SDS PAGE 跑出来的是 denature 的分子量"
上面的理由有有一个基本上的错误:
试问 "native form 的分子量" 跟 "denatured form 的分子量" 有何不同?
在 SDS PAGE 中,所谓 denature 指的是蛋白质二级以上结构的丧失
二级以上结构丧失会影响分子量吗?
或者反过来想
当我们计算一蛋白质的理论分子量的时候 可曾需要考虑二级以上结构的影响吗?
简而言之 不管有没有 denature, 分子量本身是不会变的
会变的是实验的结果能否正确反应其分子量
在蛋白质电泳中 若不 denature 则反而不能反映正确的分子量
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And my soul from out that shadow that lies floating on the floor
在那地板上浮动的影子中的我的灵魂
Shall be lifted- nevermore!
将永不再起...
--The Raven by E.A.Poe
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※ Origin: 生命科学 BBS <bbs.life.nthu.edu.tw>
◆ From: cpe-66-61-25-1.neo.res.rr.com
1F:推 chvkimo:换句话说:SDS-PAGE denature是要去除结构所造成电泳的影响 10/10 01:59
2F:推 boblu: 然也 10/10 03:23