看板Biotech
标 题Re: [问题] 关於检测突变的方法
发信站清华生命科学 BBS (Wed Jun 13 19:32:17 2007)
转信站ptt!Group.NCTU!grouppost!Group.NCTU!nthuls
> (ND4 mutation in transitional cell carcinoma: Does mitochondrial mutation
> occur before tumorigenesis? C.Y. Tzen,Mitochondrion,2007,273-278)
> 作者用了三种方法来检查:
> DNA sequencing
> RFLP
> DHPLC(denaturing HPLC)
> 而文中提到,三种方法的sensitivity是定序最低,RFLP其次,DHPLC最高
> 我想,sensitivity是指只需少量sample就能有结果吧
> a.但如果在知道mtDNA序列的情况下,用PCR放大不就没有sensitivity高低的疑虑
> 还有,既然要找突变,那检查的正确性应该比较重要
> 我以为定序应该最正确,因为两个序列一对马上就知道哪里突变了
> b.问了朋友,说定序很容易出错,但他也不会解释,请问是为什麽呢?
> 然後这个朋友一直跟我说,和定序相比,RFLP就可靠多了
> c.但我觉得,要是突变不是发生在切位上的话根本就检查不出来阿,怎麽会比较正确?
人的细胞动辄数百个粒腺体
每个都有DNA
也不是没一粒腺体DNA都有突变
有的细胞带有突变的粒线体多
有的则少
直接定序不一定可以找到突变
因此敏感度可能不是那麽好
--
※ Origin: 生命科学 BBS <bbs.life.nthu.edu.tw>
◆ From: 61-59-139-151.adsl.static.seed.net.tw