作者KECCO (毕业V.S失业)
看板Biotech
标题Re: [问题] 请问质谱仪如何订出蛋白质序列?
时间Sat Apr 28 21:50:19 2007
※ 引述《untilnow (炸～猪排)》之铭言：
: ※ 引述《mason (错愕...渺小...)》之铭言：
: : 请问质谱仪如MS/MS, 如 ESI-Q-TOF 是怎嚜订出蛋白质序列的@@?
: : 可以解释ㄧ下吗?
: : 先在应该没有人在用sanger method 了吧@@>?
: : 谢谢^^
好比说 一个protein MW=5000
经过质谱能量的提供会将a.a. 打断
而可以看到 断一个aa.的分子量 譬如说4911 打断两个变成4778
所以会在质谱图上看到 断不同数量的a.a.後的分子量讯号
在将两根讯号相扣得到单一个的a.a的序列
以上述的例子就是 (5000-4911=89, Ala), (4911-4778=133, Asp)
这样拼拼凑起结果~
有了解到吧~~!!所以 可以得到protein seq.
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 220.139.45.168
1F：推 mason:有点类似Edman Degradation,但质谱的断法好像是片段化@@>? 04/29 13:40
2F：推 untilnow:MW 5000 会再使用TRYPSIN等酵素切成小块 04/29 17:05
3F：推 tonbushai:是利用Data base 来比对已知质谱图吗?? 05/01 00:58
4F：推 untilnow:应该说,利用不止一种酵素分别切成小段，来确任每一小段 05/01 11:03
5F：→ untilnow:的蛋白质序列，及每小段的排列方式 （因为不是每个点 05/01 11:04
6F：→ untilnow:的断裂机率都一样） 05/01 11:04
7F：→ untilnow:对己知蛋白，trypsinize後的PATTEN可以向DATABASE比对 05/01 11:05
8F：→ untilnow:但未知蛋白也可以使用它来定序 05/01 11:06