nCoV2019 板


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先說明,目前的藥物治療主要是建立在結構預測以及過往研究上 僅就學理及作用機制上做解說: 首先來看 SARS-Cov的 life-cycle (2019-Cov同屬 Betacoronavirus,機制差不多) https://imgur.com/GkytaPN (https://www.nature.com/articles/nrmicro2090) 其中,目前被用來測試治療的抗病毒藥物主要有兩個: 1. Lopinavir/Ritonavir (HIV Protease inhibitor) 2. Remdesivir (GS-5734) (Adenosine analogue, RdRp inhibitor) 先來講 Lopinavir/Ritonavir,這兩個藥物是一起使用的 Ritonavir本身除了也是 Protease inhibitor,也可作用於肝臟代謝酵素 Cytochrome P450 3A4 (CYP3A4),降低 Lopinavir被肝臟代謝的速度提高其血藥濃度 再來就說到 Protease在病毒感染中的作用: 病毒RNA會先轉譯出病毒的多蛋白 (Polyprotein): pp1a (ORF1a), pp1ab (ORF1ab) 這個多蛋白本身還沒啥作用,必須先被病毒的 Protease切開,才能組成 RNA replicase-transcriptase complex,進行後續病毒蛋白合成及RNA複製 而 Betacoronavirus主要有兩種 Protease: (1) Papain-like protease (PLpro) (2) 3C-like protease (3CLpro, Mpro) 而這次選出的 Lopinavir/Ritonavir,主要抑制 Mpro https://imgur.com/62wyVaM (a. 2019-nCov和 Sars-Cov的 Mpro序列比較,紅色的部分為藥物和 Mpro形成 H bond的點 b. 2019-nCov和 Sars-Cov的 Mpro結合位點 c. Lopinavir和 2019-nCov的模擬結合模型) https://imgur.com/DbyyLp2 (左至右: Ritonavir和 2019-nCov的 Mpro模擬結合模型, 關鍵區放大,以及預測的 關鍵結合位殘基鍵結) 這次能快速篩選出藥物,除了基於先前許多 SARS-Cov的藥物研究 (像是2008年的這篇 https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0022519308003718) 也歸功於 Molecular dynamics analysis,能夠模擬分子之間的結合狀況 (其餘詳細資訊可參考 duriamon大給的這網站 https://innophore.com/2019-ncov/) 才會這麼快找出能匹配抑制 protease的藥物 所以一堆人說啥一定是人造生化武器,不然怎那麼快就知道要用啥藥物 我也不知該說啥 再來說 Remdesivir,原本是被開發用來治療 Ebola virus的藥物,但效果普通 (目前治療 Ebola有希望的是多重單株抗體 REGN-EB3及 mAb114) 這是 Remdesivir的結構 https://imgur.com/21dhNaS (https://en.wikipedia.org/wiki/Remdesivir) 其和 Adenosine最大差異在於五碳醣的1號碳上多了cyano group 在三磷酸化後,可以和ATP競爭 RdRp 但接上去後可以阻止鏈延長,阻斷RNA合成 基本上 Nucleoside/Nucleotide analogue作用機制都類似 像是HIV的 NRTI/NNRTI 至於 最後講一下我昨天發的文 https://webptt.com/m.aspx?n=bbs/nCoV2019/M.1580544204.A.152.html 那篇說 2019-nCov的序列和 HIV-1序列相似的 paper已經撤回了 結果新唐人今天還又引用這篇 paper寫新聞 然後底下不意外又各種陰謀論高潮 我只能說 https://imgur.com/qhuvT9y 原本想貼到八卦版,但無奈登入次數不夠,希望有人能幫忙轉文 讓多點人了解 至於推文提到泰國使聯合使用 Lopinavir/Ritonavir及 Oseltamivir治療 我想會有用主要是因前者, Oseltamivir會試來治療 MERS-Cov 是因為它除了會結合DPP4外,也會結合 Sialic acid 而 Oseltamivir是 Sialic acid analogue,所以有一些幫助 但這次 2019-nCov目前還沒看到跟 Sialic acid有強關聯 所以幫助應該不太大 --



※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 61.230.116.220 (臺灣)
※ 文章網址: https://webptt.com/m.aspx?n=bbs/nCoV2019/M.1580652447.A.C9E.html
1F:推 jonsauwi: 推講解,果然我病毒學都還老師了... 02/02 22:13
※ 編輯: Reflection11 (61.230.116.220 臺灣), 02/02/2020 22:15:47
2F:推 aa85ss20: 推認真講解,現在模擬分子間結合狀況的軟體真的越來越猛 02/02 22:16
3F:→ aa85ss20: ,甚至能模擬藥物動力過程 02/02 22:16
※ 編輯: Reflection11 (61.230.116.220 臺灣), 02/02/2020 22:19:45
4F:推 chocopie: 推 02/02 22:18
5F:推 ismail: 推R大 02/02 22:19
6F:推 duriamon: 辛苦你了,整理這些資訊!身為專業人士就是要提供正確客 02/02 22:20
7F:→ duriamon: 觀的資訊。現在到處一堆文組陰謀論八卦懶人包,把鄉民都 02/02 22:20
8F:→ duriamon: 慣壞了,變成只會茶來張口飯來伸手,枉費大部份的人都有 02/02 22:20
9F:→ duriamon: 大學學歷,但卻沒有邏輯判斷能力,真是遺憾。 02/02 22:20
10F:→ duriamon: 前面打錯,更正是茶來伸手飯來張口。 02/02 22:21
h54747:轉錄至看板 Gossiping 02/02 22:22
11F:推 h54747: 已轉文 02/02 22:22
12F:推 ismail: 今天泰國有新聞還有用克流感治療,R大d大有興趣看一下嗎 02/02 22:22
13F:→ ismail: https://news.ch7.com/detail/392048 02/02 22:23
我回在文章最下方了~
15F:推 saimeitetsu: 抗HIV藥物應該就是該病毒RdRP有conservative region 02/02 22:24
16F:→ saimeitetsu: 使得已知藥物有廣泛效果;至於HIV片段插入,感覺現 02/02 22:24
17F:→ saimeitetsu: 在來看證據就是不足。後續實驗室分離病毒會越來越多 02/02 22:24
18F:→ saimeitetsu: ,就可以漸漸明朗了,只是用cell line繁殖出的病毒 02/02 22:24
19F:→ saimeitetsu: 結構上和本質是不是也會有改變要再去驗證 02/02 22:24
20F:推 abc22826320: 抱歉問個伸手的問題,預防愛滋的藥物Truvada能預防武 02/02 22:26
21F:→ abc22826320: 漢肺炎嗎? 02/02 22:26
不太確定, Truvada是 Tenofovir/Emtricitabine這兩種藥物混合,雖然都是NRTI 但目前沒看到相關研究
22F:推 yys310: 推 02/02 22:28
※ 編輯: Reflection11 (61.230.116.220 臺灣), 02/02/2020 22:42:24
23F:推 jim052: 推 02/02 22:43
24F:推 XDdong: 推 現在都盡量只看專版 02/02 22:44
25F:推 tocatch: 推 02/02 22:44
※ 編輯: Reflection11 (61.230.116.220 臺灣), 02/02/2020 22:48:02
26F:推 qqq5890003: 推 02/02 22:45
27F:推 joygo: 沒用,他的文章下面有好多次都有人回覆了 02/02 22:47
28F:→ joygo: 八卦早上一篇,中國用藥,明明美國先用,真的是看八卦越看 02/02 22:48
29F:→ joygo: 越無言 02/02 22:48
30F:→ joygo: 本來想說看d 大都回無數次了 02/02 22:49
31F:推 face: 想請問這些藥物台灣是否可以使用? 02/02 22:52
Lopinavir/Ritonavir的商品名叫 Kaletra(快利佳),主要配合 AZT/3TC治療 HIV
32F:推 nomorepipe: 感謝解說 02/02 22:52
※ 編輯: Reflection11 (61.230.116.220 臺灣), 02/02/2020 23:00:39
33F:推 rainHime: 修過三學分病毒學,勉強能看懂,但八卦那邊應該無法理解 02/02 22:57
34F:推 abc22826320: 爬了一些文,發現truvada裡面的Emtricitabine似乎只 02/02 22:57
35F:→ abc22826320: 對hiv跟b肝有用,另一個成分就不知道了 02/02 22:57
36F:推 jimmylily: 推,沒辦法中國平常名聲太壞了大家趁這個機會炮一炮, 02/02 23:01
37F:→ jimmylily: 謝謝你的詳細分析 02/02 23:01
38F:推 joygo: 好奇問,現在有看到無症狀肺部玻璃的,有可能到重症都無症 02/02 23:07
39F:→ joygo: 狀嗎? 02/02 23:07
40F:推 zseineo: 推 02/02 23:09
41F:推 duriamon: Truvada是Emtricitabine/tenofovir這兩個藥物的組合產品 02/02 23:22
42F:→ duriamon: ,Emtricitabine是鎖定HIV的reverse transcriptase (RT) 02/02 23:22
43F:→ duriamon: ,也就是卡住HIV這個RNA病毒在感染過程中必需先把RNA轉 02/02 23:22
44F:→ duriamon: 成DNA然後才能執行遺傳命令。由於2019-nCoV這個RNA冠狀 02/02 23:22
45F:→ duriamon: 病毒不是透過RT而是一個叫做RNA dependent RNA polymers 02/02 23:22
46F:→ duriamon: e (RdRp)的酵素直接複製並執行病毒攜帶的RNA遺傳命令, 02/02 23:22
47F:→ duriamon: 因此Emtricitabine應該是沒辦法拿來用。 02/02 23:22
48F:推 duriamon: Tenofovir也是卡RT,原理是作為RNA轉DNA時所需要的去氧 02/02 23:26
49F:→ duriamon: 核糖核酸材料,騙RT拿去合成DNA然後卡住做不下去。 02/02 23:26
50F:推 vizcacha: 推推 02/02 23:39
51F:推 elcnick: 推這篇,而且該追究的是中共隱瞞消息而不是源頭 02/02 23:39
52F:推 Wengboyu: 太專業了 希望有沒修過病毒學也聽得懂的 02/02 23:43
53F:推 peterou1236: ...我居然看懂了 02/02 23:47
54F:推 kinomon: 推 02/02 23:49
55F:推 ishowhand: 專業推 02/02 23:54
56F:推 silentence: 缺proofreading 的關係 可以拿一些核甘和核甘酸類似 02/02 23:54
57F:→ silentence: 物去騙看看 02/02 23:55
58F:→ vinca: 想問一下(抱歉伸手牌):SARS那時也有用抗病毒藥但效果不彰 02/03 00:06
59F:→ vinca: ,這個病毒和SARS相似,用藥效果新聞都說很好,怎麼差異這 02/03 00:06
60F:→ vinca: 麼大? 02/03 00:06
61F:→ vinca: 明明是相似的機轉? 02/03 00:07
62F:→ silentence: 現在講效果都還太早ZZzz 02/03 00:14
63F:推 duriamon: 就跟這次一樣,當SARS爆發時因為情況緊急所以一定是拿已 02/03 00:15
64F:→ duriamon: 經有的藥物來試,但是由於那時人類對冠狀病毒的了解沒有 02/03 00:15
65F:→ duriamon: 那麼多,所以能用的藥物有限,而且SARS最後自己消失了導 02/03 00:15
66F:→ duriamon: 致很多廠商投資打水漂。現在是因為之前SARS和MERS的經驗 02/03 00:15
67F:→ duriamon: ,科學家和藥廠對冠狀病毒越來越有興趣,然後有些非冠狀 02/03 00:15
68F:→ duriamon: 病毒的藥物跟冠狀病毒有一些類似的機制,再加上定序技術 02/03 00:15
69F:→ duriamon: 突飛猛進,在加上之前SARS的經驗,因此這次中共的反應相 02/03 00:15
70F:→ duriamon: 當迅速。我認為他們那邊的確培養了很多相關優秀人才,像 02/03 00:15
71F:→ duriamon: 這次知道要先想辦法分離病毒並將基因組定序,這是正確的 02/03 00:15
72F:→ duriamon: 做法,讓現在全世界的防疫專家、科學家跟藥廠能同步研究 02/03 00:15
73F:→ duriamon: 這個疾病。 02/03 00:15
74F:→ duriamon: 當然這些藥物有沒有效還言之過早,詳細情況要等相關醫學 02/03 00:17
75F:→ duriamon: 研究出的案例跟統計數據。 02/03 00:17
76F:推 a1qazbgt5: 推 02/03 00:31
77F:→ vinca: 謝謝說明 我知道現在講療效太早了 02/03 00:31
78F:推 abc22826320: 感謝duriamon解答 02/03 01:08
79F:推 jyk99: 推 謝謝分享 02/03 01:36
80F:推 unknow: 專業推 02/03 01:37
81F:推 iren0818: 推 用心 02/03 01:47
82F:推 avans: 推 02/03 02:14
83F:推 Lindeman5566: 專業推 02/03 02:46
84F:推 knightzero: 併用interferon beta 1b好像也是主流之一 02/03 03:22
85F:→ knightzero: ribavirin 之前在SARS/MERS CoV都有人試,不知道這次 02/03 03:24
86F:→ knightzero: 會不會也用 02/03 03:24
87F:推 ECZEMA: 推這篇 02/03 03:37
88F:推 perryppo: Ribavirin 之前SARS好像都沒啥beneficial 02/03 04:57
89F:推 JF5385: 推 02/03 07:02
90F:推 seeback: 推 02/03 07:17
91F:推 tannie1005: 推專業 02/03 09:38
92F:推 aassdd926: 推專業 02/03 10:54
93F:推 zalora: 那瘧疾的藥為什麼可以用來治療呢? 02/03 11:07
94F:→ zalora: 能不能也請你說明一下 02/03 11:08
我回在八卦了
95F:推 switch: 推 02/03 12:15
96F:推 youseeseeu: 講解推 02/03 13:18
※ 編輯: Reflection11 (59.115.119.230 臺灣), 02/03/2020 13:24:11
97F:推 arue: 推推 02/03 20:13
98F:推 x886571: 推 02/04 08:19
99F:推 warrenchen: 感謝分享101.136.163.166 06/23 23:25







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