ㄜ... 我終於開始打算做我的R作業了 XD 可是我發現我還是沒辦法想像我到底應該做些什麼 @@ 在這邊問好了 有文字可以看我比較會有想像力 =.= 我的第一個問題.... 我有38個病人 七千個gene 上個作業中我們把.tsv的檔案匯入R中 然後存到一個陣列裡面 之後我們做了一個scale的動作 我的問題是... 七千個gene有七千的分數 有38個病人 在做scale的時候 那個mean是38個mean sd也是38個sd嗎 ? 如果是這樣 那做完scale之後也是得到38組normalized的分數嚕 @@? 我的第二個問題就是.... Golub的paper裡面的公式寫著P(g,c)=mean1(g)-mean2(g)/sd1(g)+sd2(g) 那mean和sd是誰的 @@? mean1應該是誰 mean2應該是誰 @@? paper裡面說class1和class2 是不是我們已經知道分類怎麼分了? 才直接拿資料來計算mean和sd ? mean1(g)如果是class1中g的mean 那是哪些東西的平均 @@? 如果要算mean應該是某些東西全部加起來然後除以某個東西 可是這些東西是什麼呢 ?? 第三個問題是..... hcluster(method= , link= ) 這樣是一個依照method方法做的cluster 所以如果我想換個cluster演算法 只要改method = XX就好了是吧 ? 那如果hcluster的method裡面沒有kmeans 我是不是應該去找個kmeans方法 然後寫成hcluster(method=kmeans(), link = ) ? 所以我如果想做PAM和CLARANS等等的演算法 就得自己去找函式 ? 問得很亂(泣) 因為我實在沒辦法figure out >"< --

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