ㄜ... 我终於开始打算做我的R作业了 XD 可是我发现我还是没办法想像我到底应该做些什麽 @@ 在这边问好了 有文字可以看我比较会有想像力 =.= 我的第一个问题.... 我有38个病人 七千个gene 上个作业中我们把.tsv的档案汇入R中 然後存到一个阵列里面 之後我们做了一个scale的动作 我的问题是... 七千个gene有七千的分数 有38个病人 在做scale的时候 那个mean是38个mean sd也是38个sd吗 ? 如果是这样 那做完scale之後也是得到38组normalized的分数噜 @@? 我的第二个问题就是.... Golub的paper里面的公式写着P(g,c)=mean1(g)-mean2(g)/sd1(g)+sd2(g) 那mean和sd是谁的 @@? mean1应该是谁 mean2应该是谁 @@? paper里面说class1和class2 是不是我们已经知道分类怎麽分了? 才直接拿资料来计算mean和sd ? mean1(g)如果是class1中g的mean 那是哪些东西的平均 @@? 如果要算mean应该是某些东西全部加起来然後除以某个东西 可是这些东西是什麽呢 ?? 第三个问题是..... hcluster(method= , link= ) 这样是一个依照method方法做的cluster 所以如果我想换个cluster演算法 只要改method = XX就好了是吧 ? 那如果hcluster的method里面没有kmeans 我是不是应该去找个kmeans方法 然後写成hcluster(method=kmeans(), link = ) ? 所以我如果想做PAM和CLARANS等等的演算法 就得自己去找函式 ? 问得很乱(泣) 因为我实在没办法figure out >"< --

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