作者telepathy (RainbowDog)
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標題Re: [討論] 有關NNT(Number needed to test)的疑問
時間Tue Jul 30 14:08:06 2013
※ 引述《anovachen (囧)》之銘言：
: ※ 引述《telepathy (RainbowDog)》之銘言：
: : Prevalence: 4.35%
: : Case(+)/total: 6/18 (33.3%)
: : Control(+)/total: 4/144 (2.8%)
: : Odds ratio: 17.5
: : P value: 2.2x10^-3
: : Sensitivity: 33.0
: : Specificity: 97.2
: : PPV: 34.9 % (以Prevalence, sensitivity, specificity校正)
: : NPV: 96.7 % (同上)
: : NNT: 91 ???
: → bmka:你算NNT的目的是什麼? 07/30 04:08
: → bmka:3.3怎麼看怎麼不對 07/30 04:09
: 推 anovachen:是答案不對，還是這答案沒有意義? 因為ARR是介入前 07/30 11:46
: → anovachen:發生率-介入後發生率。這邊似乎資訊不足以計算ARR? 07/30 11:47
: D D'
: E 6 12 (33.3%)
: E' 4 140 (2.8%)
: OR=(6*140)/(4*12)=17.5
: 問題是，暴露與非暴露代表的是治療的介入與否嗎？
: 如果暴露=介入，這樣很奇怪，反而介入組發病的比率(33.3%)更高。
: 到底這題能不能算NNT阿？
: 不知原PO能不能提供原始論文的連結？
當然可以!!!
HLA genotype and carbamazepine-induced cutaneous Adverse Drug Reactions:
A systematic review
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23132554
我想知道~ Table2的表格 NNT怎麼算的??
上面原文是作者表格中第一個分析
下面是第二個例子
Prevalence: 2.9%
Population frequency: 7.1-12%
Case(+)/total: 45/77 (58.4%)
Control(+)/total: 54/420 (12.9%)
Odds ratio: 9.5
P value: 1.1x10^-16
Sensitivity: 58.4
Specificity: 87.1
PPV: 11.9 % (以Prevalence, sensitivity, specificity校正)
NPV: 98.6 % (同上)
NNT: 67 ???
由於Paper表格中列出三個例子, 都是我用簡單定義"NNT=1/ARR"算不出來的
(應該可以排出Paper自己算錯的可能?!)
我自已的例子是
Prevalence: 0.05%
Case(+)/total: 7/10 (70%)
Control(+)/total: 10/257 (3.9%)
Odds ratio: 57.6
P value: 1.19x10^-7
Sensitivity: 70
Specificity: 96.1
PPV: 0.89 % (以Prevalence, sensitivity, specificity校正)
NPV: 99.98 % (同上)
NNT: ???
我不知道NNT是不是有其他公式或是定義
或是還需要考慮什麼, 該怎麼修正才好
非常感謝各位的回覆 :)
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There are things we don’t wanna happen, but have to accept.
Things we don’t wanna know, but have to learn.
And people we can’t live without, but have to let go.
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 120.126.49.222
1F：→ bmka:不要動不動就套公式，先説清楚你的scientific problem 07/30 19:49
2F：→ telepathy:這是meeting時被問到的問題,我對NNT一開始完全不懂 07/30 23:46
3F：→ telepathy:後來只能Google, 才知道定義跟公式 07/30 23:46
4F：→ telepathy:我也很不希望直接套公式>< 07/30 23:47
5F：→ telepathy:但我不知道除了套公式外,我該怎麼回答NNT... 07/30 23:48
6F：→ telepathy:最大的問題在於,我想算出跟Paper一樣的NNT...Orz 07/30 23:50
7F：→ bmka:你算NNT是為了回答什麼問題? 07/31 00:06
8F：→ telepathy:基因檢測,回答"要檢測多少病人才能預防一位發病" 07/31 00:15
9F：→ telepathy:但這個疾病的Prevalence很低,只有0.05% 07/31 00:16
10F：→ telepathy:每萬人才5位,但NNT1/(70%-3.9%)=1.5,絕對不合理! 07/31 00:19
11F：→ yhliu:套公式沒什麼, 但亂套公式可不行, 你套的公式是有病與無病者 07/31 13:39
12F：→ yhliu:篩檢結果是陽性比例, 這與你想表達的差了十萬八千里. 07/31 13:40
13F：→ yhliu:我不清楚原文是怎麼算的, 你應再查看原文有無說明. 不過, 如 07/31 13:41
14F：→ yhliu:果你想要表達的是病病篩檢可以減少有病而不自知的情況, 一個 07/31 13:42
15F：→ yhliu:想法是 ARR 用 Prevalence rate 與 (1-NPV) 的差 --- 1-NPV 07/31 13:43
16F：→ yhliu:是 test 為陰性但其實有病的條件機率. 這樣的計算在第二個例 07/31 13:44
17F：→ yhliu:子吻合; 但第一個例子則不合. 不過, 第一個例子我計算得的 07/31 13:45
18F：→ yhliu:NPV 是0.9696 而非你前文所列的. 07/31 13:46
19F：→ yhliu:若依你所列的, 計算時再先異捨五入一下: ARR = 0.044-0.033 07/31 13:47
20F：→ yhliu:則 ARR = 0.011 而 NNT = 1/0.011 = 91 吻合. 07/31 13:47
21F：→ yhliu:"四捨五入" 上面打成 "異捨五入" 了. orz 07/31 13:48
22F：→ yhliu:依上述想法, 你的例子 NNT = 1/(0.0005-0.0002) = 3333 07/31 13:51
23F：→ telepathy:喔喔!!! 謝謝您!!! 07/31 18:22
24F：→ telepathy:感謝所有熱心的回應 :) 07/31 23:42