作者gsuper (統計的巴比倫塔)
看板Statistics
標題[問題] Odd Ratio 的互相比較
時間Tue Dec 28 01:07:41 2010
CONTROL CASE
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GG | 10 | 10 |
|--------|-------|
AG | 10 | 20 |
|--------|-------|
AA | 10 | 30 | (數字不重要)
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這是一個 3*2 的 contigency table
拿上面四格先計算一次
OR1 (AG當風險)
拿下面四格計算第二次
OR2 (AA當風險)
請問應該用甚麼統計方法才能檢定以下假說
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Ho :
OR1 ==
OR2
Ha :
OR1 !=
OR2
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P.S.
這是 Biological genetic model 的判斷式
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補充資料(PAPER上的)
GG versus AA (OR1),
AG versus AA (OR2),
GG versus AG (OR3).
Dominant model : (OR1 == OR2 != 1) && (OR3 == 1)
Recessive model : (OR1 == OR3 != 1) && (OR2 == 1)
Over-dominant model : (OR2 == 1/OR3 != 1) && (OR1 == 1)
Co-dominant model : (OR1 > OR2 > 1) && (OR1 > OR3 > 1)
或(OR1 < OR2 < 1) && (OR1 < OR3 < 1)
== 和 != 是憑 P-value < 0.1 or > 0.1 來判斷
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◆ From: 140.113.239.247
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1F：→ kingbee:那不就在比較 AG/AA=1 ? 12/28 09:07
2F：→ kingbee:倒是沒看過OR與OR在互比 頂多往SRR那種方向 12/28 09:09
3F：→ ADORIAN:logistic regression, Mantel-Haenszel test, .... 12/28 10:40
4F：→ ADORIAN:行不行 ? 12/28 10:42
5F：→ bmka:logistic regression is appropriate, but MH test?? 12/28 11:02
6F：→ ADORIAN:呵~ 我只是憑印象回答, 很久沒有碰 MH test, 也不知可否. 12/28 11:17
7F：→ ADORIAN:所以又丟出個問題, 請原 po 想想看. 12/28 11:17
謝謝大家
我去研究一下 MH test
邏輯回歸我不太會跑
不過不能用 LR test 嗎?
我記得那個好像可以比較 2個 test statistic (我不太確定)
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8F：→ yhliu:你的 OR's 與 paper 上的不同. 12/28 16:11
不好意思 , 我的是倒過來的
不過應該不影響原意
因為3個OR值 , OR1 ~ OR3 都必須交叉比對過
9F：→ yhliu:依你的符號, fit the model with OR1=OR2, 此 model 的 12/28 16:11
10F：→ yhliu:goodness of fit 即是你要的. 此 model 可以用 logistic 12/28 16:12
11F：→ yhliu:regression 完成, 即給予各列 equal-space score. 12/28 16:13
"equal-space score"
恩恩
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12F：→ bmka:查一下logistic regression的likelihood ratio test 12/28 21:24
13F：推 LITTLEN:要不要用permutation test算 OR1-OR2的 p-value 12/30 04:04