作者gsuper (统计的巴比伦塔)
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标题[问题] Odd Ratio 的互相比较
时间Tue Dec 28 01:07:41 2010
CONTROL CASE
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GG | 10 | 10 |
|--------|-------|
AG | 10 | 20 |
|--------|-------|
AA | 10 | 30 | (数字不重要)
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这是一个 3*2 的 contigency table
拿上面四格先计算一次
OR1 (AG当风险)
拿下面四格计算第二次
OR2 (AA当风险)
请问应该用甚麽统计方法才能检定以下假说
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Ho :
OR1 ==
OR2
Ha :
OR1 !=
OR2
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P.S.
这是 Biological genetic model 的判断式
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补充资料(PAPER上的)
GG versus AA (OR1),
AG versus AA (OR2),
GG versus AG (OR3).
Dominant model : (OR1 == OR2 != 1) && (OR3 == 1)
Recessive model : (OR1 == OR3 != 1) && (OR2 == 1)
Over-dominant model : (OR2 == 1/OR3 != 1) && (OR1 == 1)
Co-dominant model : (OR1 > OR2 > 1) && (OR1 > OR3 > 1)
或(OR1 < OR2 < 1) && (OR1 < OR3 < 1)
== 和 != 是凭 P-value < 0.1 or > 0.1 来判断
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◆ From: 140.113.239.247
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1F：→ kingbee:那不就在比较 AG/AA=1 ? 12/28 09:07
2F：→ kingbee:倒是没看过OR与OR在互比 顶多往SRR那种方向 12/28 09:09
3F：→ ADORIAN:logistic regression, Mantel-Haenszel test, .... 12/28 10:40
4F：→ ADORIAN:行不行 ? 12/28 10:42
5F：→ bmka:logistic regression is appropriate, but MH test?? 12/28 11:02
6F：→ ADORIAN:呵~ 我只是凭印象回答, 很久没有碰 MH test, 也不知可否. 12/28 11:17
7F：→ ADORIAN:所以又丢出个问题, 请原 po 想想看. 12/28 11:17
谢谢大家
我去研究一下 MH test
逻辑回归我不太会跑
不过不能用 LR test 吗?
我记得那个好像可以比较 2个 test statistic (我不太确定)
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※ 编辑: gsuper 来自: 140.113.239.247 (12/28 15:55)
※ 编辑: gsuper 来自: 140.113.239.247 (12/28 16:03)
8F：→ yhliu:你的 OR's 与 paper 上的不同. 12/28 16:11
不好意思 , 我的是倒过来的
不过应该不影响原意
因为3个OR值 , OR1 ~ OR3 都必须交叉比对过
9F：→ yhliu:依你的符号, fit the model with OR1=OR2, 此 model 的 12/28 16:11
10F：→ yhliu:goodness of fit 即是你要的. 此 model 可以用 logistic 12/28 16:12
11F：→ yhliu:regression 完成, 即给予各列 equal-space score. 12/28 16:13
"equal-space score"
恩恩
※ 编辑: gsuper 来自: 140.113.239.247 (12/28 16:20)
12F：→ bmka:查一下logistic regression的likelihood ratio test 12/28 21:24
13F：推 LITTLEN:要不要用permutation test算 OR1-OR2的 p-value 12/30 04:04