作者gsuper (統計的巴比倫塔)
看板Statistics
標題[問題] 問一種統計方法的名稱
時間Mon Oct 11 23:05:57 2010
假設資料如下
SNP1 SNP2 SNP3 SNP4 SNP5 SNP6 SNP7
病人 A A T C G A G G
病人 B C T C G C A C
正常人C A C T C C G C
正常人D A C T G A G C
這個實驗的目的是要找到可能致病的 SNP cluster
(換句話說就是挑出對 case/control 有解釋力的 multiple features)
三種顏色分別代表 SNP 座落於三種基因之上
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像這樣同時具有 case/control association study
又包含 logistic regression
而且還要考慮到 SNP 坐落於不同基因之內
請問這樣的複合型的統計方法有甚麼特定的名字嗎?
比方說多變量多元邏輯回歸之類的?
還是說要分成很多個 stages 來計算?
### SNP 總共 100萬
case+control 約 5000人
基因總數約 3萬
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 140.113.239.247
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※ 編輯: gsuper 來自: 140.113.239.247 (10/11 23:10)
1F：→ clickhere:QTL, TDT, lod score, ... 10/12 08:31
2F：→ clickhere:先cluster降維,再做association test. 10/12 08:33
3F：→ clickhere:如果有方法可以一起做, 麻煩通知一下, 我也想知道. 10/12 08:35
4F：→ gsuper:你可以看看這篇 10/12 13:06
6F：→ gsuper:我是剛起步 所以實在是吸收不了 或許你可以試試看他的流程 10/12 13:06
7F：→ clickhere:2F大概就是了.如何降維,且要不影響後續,都是問題. 10/12 22:53
2F 不會是在說我吧
我就是原 Po 阿
那篇就是等級太高看不懂才過來問問看
那個 "你" 不是在跟我自己說的阿 XDDDD
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※ 編輯: gsuper 來自: 140.113.239.247 (10/12 23:27)
8F：→ clickhere:我講的是我. RF&MDR都算降維. 通篇畫了個大餅.... 10/14 09:05
9F：→ clickhere:揀顆屑屑可能就做不完了. 10/14 09:06
10F：→ clickhere:那段看不懂? 我只是興趣, 不做這個. 10/14 09:11
11F：→ gsuper:概念都還OK , 但是離實做還有一大段距離 10/14 13:30