作者gsuper (统计的巴比伦塔)
看板Statistics
标题[问题] 问一种统计方法的名称
时间Mon Oct 11 23:05:57 2010
假设资料如下
SNP1 SNP2 SNP3 SNP4 SNP5 SNP6 SNP7
病人 A A T C G A G G
病人 B C T C G C A C
正常人C A C T C C G C
正常人D A C T G A G C
这个实验的目的是要找到可能致病的 SNP cluster
(换句话说就是挑出对 case/control 有解释力的 multiple features)
三种颜色分别代表 SNP 座落於三种基因之上
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像这样同时具有 case/control association study
又包含 logistic regression
而且还要考虑到 SNP 坐落於不同基因之内
请问这样的复合型的统计方法有甚麽特定的名字吗?
比方说多变量多元逻辑回归之类的?
还是说要分成很多个 stages 来计算?
### SNP 总共 100万
case+control 约 5000人
基因总数约 3万
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.113.239.247
※ 编辑: gsuper 来自: 140.113.239.247 (10/11 23:07)
※ 编辑: gsuper 来自: 140.113.239.247 (10/11 23:09)
※ 编辑: gsuper 来自: 140.113.239.247 (10/11 23:10)
1F：→ clickhere:QTL, TDT, lod score, ... 10/12 08:31
2F：→ clickhere:先cluster降维,再做association test. 10/12 08:33
3F：→ clickhere:如果有方法可以一起做, 麻烦通知一下, 我也想知道. 10/12 08:35
4F：→ gsuper:你可以看看这篇 10/12 13:06
6F：→ gsuper:我是刚起步 所以实在是吸收不了 或许你可以试试看他的流程 10/12 13:06
7F：→ clickhere:2F大概就是了.如何降维,且要不影响後续,都是问题. 10/12 22:53
2F 不会是在说我吧
我就是原 Po 阿
那篇就是等级太高看不懂才过来问问看
那个 "你" 不是在跟我自己说的阿 XDDDD
※ 编辑: gsuper 来自: 140.113.239.247 (10/12 23:22)
※ 编辑: gsuper 来自: 140.113.239.247 (10/12 23:27)
8F：→ clickhere:我讲的是我. RF&MDR都算降维. 通篇画了个大饼.... 10/14 09:05
9F：→ clickhere:拣颗屑屑可能就做不完了. 10/14 09:06
10F：→ clickhere:那段看不懂? 我只是兴趣, 不做这个. 10/14 09:11
11F：→ gsuper:概念都还OK , 但是离实做还有一大段距离 10/14 13:30