以下是soem大的回應 還有我的問題 (徵得soem大同意附上） ※ 引述《flied (libertines)》之銘言： : ※ 引述《soem (流水)》之銘言： : : 這應該就是可以直接call得到talys指令了 : : 這是之前的文章 : : 這是後來你執行的狀況 : : 請注意妳現在的所在目錄， : : 比對兩次結果，你是不是該去 ~/physics/talys/samples 尋找你的verify : : 雖然不知道為甚麼你會在/bin裡面，姑且推論一下你的想法好了： : : 1. 你可能認為執行檔要在/bin底下才能跑？ : : => 實際上不用，跟檔案權限有關系 : : 但要注意的是，如果你要執行的不是在系統$PATH裡面的程式， : : 要用相對或絕對路徑的方式去呼叫。 : : 像是你在 ~/physics/talys/samples裡面呼叫相對路徑 "./": : : ~/physics/talys/samples$ ./verify : : 或是絕對路徑 : : /home/你的帳號/physics/talys/samples/verify : : 若是你直接呼叫verify，就是呼叫到系統預先有的那隻verify工具。 : : 2. 你可能不確定chmod的功能以及"bash: ./verify: 拒絕不符權限的操作"的成因 : : => 首先無論是script或程式一般來說都需要檔案權限才能執行； : : 這邊的權現有兩個面向：你的權限，和設定給檔案的權限。 : : 我們先來看看一般權限的呈現方式： : : $ ls -ld /bin/bash : : -rwxr-xr-x 1 root root 959120 Mar 29 2013 /bin/bash : : 第一組rwx是這個檔案的擁有者root所能做的事情 : : read, write, execute : : 第二組rwx是這個檔案的擁有者群組，root群組所能做的事情 : : 所以有在root群組且非使用者root則會參考這組設定 : : 第三組rwx則是除此以外的人的權限。 : : 所以說，我們可以看到/bin/bash這個檔案， : : - 擁有者root具有所有權限； : : - 擁有者群組root沒有修改(寫入)的權限，但可以讀取和執行； : : - 剩下的人亦是沒有修改、有讀取執行的權限。 : : 一般的文字檔案類型往往是644，例如： : : $ ls -ld /etc/hosts : : -rw-r--r-- 1 root root 342 Jan 22 20:16 /etc/hosts : : 我想你的~/physics/talys/samples/verify應該也是類似的情形， : : 因此你需要的是幫他加上execute : : ~/physics/talys/samples/$ chmod +x verify : : sudo 可以幫你取得不同使用者的權限，但針對x這項設定通常需要用chmod來調整。 : 謝謝 : 我執行了這行成功 : lee@lee-X402CA:~/physics/talys/samples$ ./verify : bash: ./verify: 拒絕不符權限的操作 : lee@lee-X402CA:~/physics/talys/samples$ chmod +x verify : lee@lee-X402CA:~/physics/talys/samples$ ./verify : /home/lee/physics/talys/samples/17/a/new : /home/lee/physics/talys/samples/17/b/new : /home/lee/physics/talys/samples/17/c/new : /home/lee/physics/talys/samples/11/new : /home/lee/physics/talys/samples/10/a/new : /home/lee/physics/talys/samples/10/b/new : /home/lee/physics/talys/samples/20/new : /home/lee/physics/talys/samples/1/f/new : /home/lee/physics/talys/samples/1/g/new : /home/lee/physics/talys/samples/1/e/new : /home/lee/physics/talys/samples/1/h/new : /home/lee/physics/talys/samples/1/a/new : /home/lee/physics/talys/samples/1/b/new : /home/lee/physics/talys/samples/1/d/new : /home/lee/physics/talys/samples/1/i/new : /home/lee/physics/talys/samples/1/c/new : /home/lee/physics/talys/samples/8/new : /home/lee/physics/talys/samples/21/new : /home/lee/physics/talys/samples/3/a/new : /home/lee/physics/talys/samples/3/b/new : /home/lee/physics/talys/samples/3/d/new : /home/lee/physics/talys/samples/3/c/new : /home/lee/physics/talys/samples/22/new : /home/lee/physics/talys/samples/9/new : /home/lee/physics/talys/samples/6/a/new : /home/lee/physics/talys/samples/6/b/new : /home/lee/physics/talys/samples/19/new : /home/lee/physics/talys/samples/16/a/new : /home/lee/physics/talys/samples/16/b/new : /home/lee/physics/talys/samples/16/d/new : /home/lee/physics/talys/samples/16/c/new : /home/lee/physics/talys/samples/2/new : /home/lee/physics/talys/samples/24/new : /home/lee/physics/talys/samples/25/new : /home/lee/physics/talys/samples/12/new : /home/lee/physics/talys/samples/23/new : /home/lee/physics/talys/samples/14/new : /home/lee/physics/talys/samples/5/new : /home/lee/physics/talys/samples/15/new : /home/lee/physics/talys/samples/18/a/new : /home/lee/physics/talys/samples/18/b/new : /home/lee/physics/talys/samples/4/a/new : /home/lee/physics/talys/samples/4/b/new : /home/lee/physics/talys/samples/13/new : /home/lee/physics/talys/samples/7/new : 似乎成功 : 但readme如下 : Verification : ------------ : - cd samples : - verify : Under Linux/Unix, this should run all sample cases (about 1 hour on : a fast PC). : 我這大概3秒就結束 : 所以應該還沒有裝好 : : 這邊就只是你的系統有安裝一個叫做verify的指令， : : 但這你的使用經驗看來，那個指令並不是你這次安裝的步驟中需要呼叫到的。 : Your own calculations : --------------------- : - talys < input > output : where you can make your own input file starting from the many sample cases : we provide. : 我試著計算執行 : 錯誤如下 : lee@lee-X402CA:~/physics/talys/test$ talys input output5 soem: 先說這行: $ talys < input > output < :把檔案讀進stdin > :把s "如果"我沒有誤會他的readme的話，這行命令是: 1. 應該是要你準備個名叫input且符合他的格式的input檔案 2. 然後，會輸出結果到output檔案 格式的話，照他readme這句是他有提供一些sample可以參考。 不曉得你下面的input是不是有照這個方式呢？ (不過你得到的錯誤訊息是下面那件事情) me: 我的input是直接從sample複製貼上到test資料夾 所以格式內容是一模一樣 : TALYS-error: Structure database not installed: change path in machine.f : 我的machine.f 在 /home/lee/physics/talys/source : https://www.dropbox.com/s/zmbhzustk6hnp6v/2014-01-26%2021%3A39%3A35.png : 內容如下 : https://www.dropbox.com/s/yq6o4hbraqftuf6/2014-01-26%2021%3A32%3A21.png 因為我看不懂fortran所以只能用猜的... 他似乎是需要...嗯...可能是 home/structure/abundance/z001 那個home就是你改的變數，看看該路徑是不是有這個檔案。 有 https://www.dropbox.com/s/e46dmelae22v3jw/2014-01-27%2009%3A49%3A55.png : c ********************* Set directory for structure data *************** : c : c path : directory containing structure files to be read : c lenpath: length of pathname : c : c The maximum length of the path is 60 characters : c : home='/home/lee/physics/talys/' （我改這行） : lenhome=0 : do 10 i=1,60 : if (home(i:i).eq.' ') goto 100 : lenhome=lenhome+1 : 10 continue : 100 path=home(1:lenhome)//'structure/' : lenpath=lenhome+10 : c : c Test to check accessibility of structure files : c : inquire (file=path(1:lenpath)//'abundance/z001',exist=lexist) : if (lexist) return : write(*,'(" TALYS-error: Structure database not installed:", : + " change path in machine.f")') : stop : end : Copyright (C) 2013 A.J. Koning, S. Hilaire and S. Goriely : 我改的只有這部份 : 原本是 home='.' : 不能執行後，我改成 : home='/home/lee/physics/talys/' : 這樣改對吧？ soem : 之前FedoraHanT給的hint中這行: sed -i 's|/home/finux01b/akoning/talys/|.|' machine.f 就是把他換成 '.' me: 所以原本的 home='.' 是對的？ 但我改回 執行的錯誤一樣 TALYS-error: Structure database not installed: change path in machine.f soem : 不過更重要的是，fortan是要重新compile的喔！ 所以你改過之後也得重新compile出新的執行檔才有用。 me: 抱歉，我是超弱手，這邊要如何compile? ※ 編輯: flied 來自: 61.220.220.27 (01/27 10:53)