以下是soem大的回应 还有我的问题 (徵得soem大同意附上） ※ 引述《flied (libertines)》之铭言： : ※ 引述《soem (流水)》之铭言： : : 这应该就是可以直接call得到talys指令了 : : 这是之前的文章 : : 这是後来你执行的状况 : : 请注意你现在的所在目录， : : 比对两次结果，你是不是该去 ~/physics/talys/samples 寻找你的verify : : 虽然不知道为甚麽你会在/bin里面，姑且推论一下你的想法好了： : : 1. 你可能认为执行档要在/bin底下才能跑？ : : => 实际上不用，跟档案权限有关系 : : 但要注意的是，如果你要执行的不是在系统$PATH里面的程式， : : 要用相对或绝对路径的方式去呼叫。 : : 像是你在 ~/physics/talys/samples里面呼叫相对路径 "./": : : ~/physics/talys/samples$ ./verify : : 或是绝对路径 : : /home/你的帐号/physics/talys/samples/verify : : 若是你直接呼叫verify，就是呼叫到系统预先有的那只verify工具。 : : 2. 你可能不确定chmod的功能以及"bash: ./verify: 拒绝不符权限的操作"的成因 : : => 首先无论是script或程式一般来说都需要档案权限才能执行； : : 这边的权现有两个面向：你的权限，和设定给档案的权限。 : : 我们先来看看一般权限的呈现方式： : : $ ls -ld /bin/bash : : -rwxr-xr-x 1 root root 959120 Mar 29 2013 /bin/bash : : 第一组rwx是这个档案的拥有者root所能做的事情 : : read, write, execute : : 第二组rwx是这个档案的拥有者群组，root群组所能做的事情 : : 所以有在root群组且非使用者root则会参考这组设定 : : 第三组rwx则是除此以外的人的权限。 : : 所以说，我们可以看到/bin/bash这个档案， : : - 拥有者root具有所有权限； : : - 拥有者群组root没有修改(写入)的权限，但可以读取和执行； : : - 剩下的人亦是没有修改、有读取执行的权限。 : : 一般的文字档案类型往往是644，例如： : : $ ls -ld /etc/hosts : : -rw-r--r-- 1 root root 342 Jan 22 20:16 /etc/hosts : : 我想你的~/physics/talys/samples/verify应该也是类似的情形， : : 因此你需要的是帮他加上execute : : ~/physics/talys/samples/$ chmod +x verify : : sudo 可以帮你取得不同使用者的权限，但针对x这项设定通常需要用chmod来调整。 : 谢谢 : 我执行了这行成功 : lee@lee-X402CA:~/physics/talys/samples$ ./verify : bash: ./verify: 拒绝不符权限的操作 : lee@lee-X402CA:~/physics/talys/samples$ chmod +x verify : lee@lee-X402CA:~/physics/talys/samples$ ./verify : /home/lee/physics/talys/samples/17/a/new : /home/lee/physics/talys/samples/17/b/new : /home/lee/physics/talys/samples/17/c/new : /home/lee/physics/talys/samples/11/new : /home/lee/physics/talys/samples/10/a/new : /home/lee/physics/talys/samples/10/b/new : /home/lee/physics/talys/samples/20/new : /home/lee/physics/talys/samples/1/f/new : /home/lee/physics/talys/samples/1/g/new : /home/lee/physics/talys/samples/1/e/new : /home/lee/physics/talys/samples/1/h/new : /home/lee/physics/talys/samples/1/a/new : /home/lee/physics/talys/samples/1/b/new : /home/lee/physics/talys/samples/1/d/new : /home/lee/physics/talys/samples/1/i/new : /home/lee/physics/talys/samples/1/c/new : /home/lee/physics/talys/samples/8/new : /home/lee/physics/talys/samples/21/new : /home/lee/physics/talys/samples/3/a/new : /home/lee/physics/talys/samples/3/b/new : /home/lee/physics/talys/samples/3/d/new : /home/lee/physics/talys/samples/3/c/new : /home/lee/physics/talys/samples/22/new : /home/lee/physics/talys/samples/9/new : /home/lee/physics/talys/samples/6/a/new : /home/lee/physics/talys/samples/6/b/new : /home/lee/physics/talys/samples/19/new : /home/lee/physics/talys/samples/16/a/new : /home/lee/physics/talys/samples/16/b/new : /home/lee/physics/talys/samples/16/d/new : /home/lee/physics/talys/samples/16/c/new : /home/lee/physics/talys/samples/2/new : /home/lee/physics/talys/samples/24/new : /home/lee/physics/talys/samples/25/new : /home/lee/physics/talys/samples/12/new : /home/lee/physics/talys/samples/23/new : /home/lee/physics/talys/samples/14/new : /home/lee/physics/talys/samples/5/new : /home/lee/physics/talys/samples/15/new : /home/lee/physics/talys/samples/18/a/new : /home/lee/physics/talys/samples/18/b/new : /home/lee/physics/talys/samples/4/a/new : /home/lee/physics/talys/samples/4/b/new : /home/lee/physics/talys/samples/13/new : /home/lee/physics/talys/samples/7/new : 似乎成功 : 但readme如下 : Verification : ------------ : - cd samples : - verify : Under Linux/Unix, this should run all sample cases (about 1 hour on : a fast PC). : 我这大概3秒就结束 : 所以应该还没有装好 : : 这边就只是你的系统有安装一个叫做verify的指令， : : 但这你的使用经验看来，那个指令并不是你这次安装的步骤中需要呼叫到的。 : Your own calculations : --------------------- : - talys < input > output : where you can make your own input file starting from the many sample cases : we provide. : 我试着计算执行 : 错误如下 : lee@lee-X402CA:~/physics/talys/test$ talys input output5 soem: 先说这行: $ talys < input > output < :把档案读进stdin > :把s "如果"我没有误会他的readme的话，这行命令是: 1. 应该是要你准备个名叫input且符合他的格式的input档案 2. 然後，会输出结果到output档案 格式的话，照他readme这句是他有提供一些sample可以参考。 不晓得你下面的input是不是有照这个方式呢？ (不过你得到的错误讯息是下面那件事情) me: 我的input是直接从sample复制贴上到test资料夹 所以格式内容是一模一样 : TALYS-error: Structure database not installed: change path in machine.f : 我的machine.f 在 /home/lee/physics/talys/source : https://www.dropbox.com/s/zmbhzustk6hnp6v/2014-01-26%2021%3A39%3A35.png : 内容如下 : https://www.dropbox.com/s/yq6o4hbraqftuf6/2014-01-26%2021%3A32%3A21.png 因为我看不懂fortran所以只能用猜的... 他似乎是需要...嗯...可能是 home/structure/abundance/z001 那个home就是你改的变数，看看该路径是不是有这个档案。 有 https://www.dropbox.com/s/e46dmelae22v3jw/2014-01-27%2009%3A49%3A55.png : c ********************* Set directory for structure data *************** : c : c path : directory containing structure files to be read : c lenpath: length of pathname : c : c The maximum length of the path is 60 characters : c : home='/home/lee/physics/talys/' （我改这行） : lenhome=0 : do 10 i=1,60 : if (home(i:i).eq.' ') goto 100 : lenhome=lenhome+1 : 10 continue : 100 path=home(1:lenhome)//'structure/' : lenpath=lenhome+10 : c : c Test to check accessibility of structure files : c : inquire (file=path(1:lenpath)//'abundance/z001',exist=lexist) : if (lexist) return : write(*,'(" TALYS-error: Structure database not installed:", : + " change path in machine.f")') : stop : end : Copyright (C) 2013 A.J. Koning, S. Hilaire and S. Goriely : 我改的只有这部份 : 原本是 home='.' : 不能执行後，我改成 : home='/home/lee/physics/talys/' : 这样改对吧？ soem : 之前FedoraHanT给的hint中这行: sed -i 's|/home/finux01b/akoning/talys/|.|' machine.f 就是把他换成 '.' me: 所以原本的 home='.' 是对的？ 但我改回 执行的错误一样 TALYS-error: Structure database not installed: change path in machine.f soem : 不过更重要的是，fortan是要重新compile的喔！ 所以你改过之後也得重新compile出新的执行档才有用。 me: 抱歉，我是超弱手，这边要如何compile? ※ 编辑: flied 来自: 61.220.220.27 (01/27 10:53)