作者jimmy0930 (小蘇)
看板EZsoft
標題[推薦] Cellprofiler-強大的科學影像分析軟體
時間Fri Jan 6 09:44:22 2012
軟體名稱：
CellProfiler
軟體資訊：
英文/xp~Win7/Mac/Linux
軟體功能：
科學影像分析用，可以幫你算細胞，或是某個螢光染色的強度等等
軟體特色：
可分析像是 Arrayscan 掃出來的圖，能修改的細節相當多
可搭配 CellProfiler Analyst 作一些 Data 的分析與瀏覽
(CellProfiler Analyst 也是免費)
官方網站：
http://www.cellprofiler.org/
下載連結：
CellProfiler:
http://www.cellprofiler.org/download.shtml
CellProfiler Analyst:
http://www.cellprofiler.org/downloadCPA.shtml
推薦原因：
可以批次處理一堆圖 (圖檔有命名原則就好)
重點是免費呀，同性質的付費軟體都要將近百萬上下
另外似乎可以搭配資料庫使用 (這個找時間再來研究 XD)
誰適合用：
需要科學影像分析的人
誰不適合用：
排斥英文，懶得花時間研究此軟體的人
使用感想：
只有讚而已
可以把你要的步驟 (包括影像的前處理) 全部寫在一個 pipline 裡
可針對特定的實驗寫特定的 pipline
網站上也有許多實例可以下載參考
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1F：推 ThisIsNotKFC:感覺就是個專業軟體XD 01/06 12:07
2F：→ vixen:跟ImageJ比起來如何? 借問一下是否可轉生物版? 01/06 15:37
3F：→ jimmy0930:CellProfiler 比較偏向 high throughput 的實驗使用 01/06 16:19
※ vixen:轉錄至看板 Biology 01/06 16:25
4F：推 Rplus:感覺很帥氣的軟體 01/06 18:54