作者jimmy0930 (小苏)
看板EZsoft
标题[推荐] Cellprofiler-强大的科学影像分析软体
时间Fri Jan 6 09:44:22 2012
软体名称:
CellProfiler
软体资讯:
英文/xp~Win7/Mac/Linux
软体功能:
科学影像分析用,可以帮你算细胞,或是某个萤光染色的强度等等
软体特色:
可分析像是 Arrayscan 扫出来的图,能修改的细节相当多
可搭配 CellProfiler Analyst 作一些 Data 的分析与浏览
(CellProfiler Analyst 也是免费)
官方网站:
http://www.cellprofiler.org/
下载连结:
CellProfiler:
http://www.cellprofiler.org/download.shtml
CellProfiler Analyst:
http://www.cellprofiler.org/downloadCPA.shtml
推荐原因:
可以批次处理一堆图 (图档有命名原则就好)
重点是免费呀,同性质的付费软体都要将近百万上下
另外似乎可以搭配资料库使用 (这个找时间再来研究 XD)
谁适合用:
需要科学影像分析的人
谁不适合用:
排斥英文,懒得花时间研究此软体的人
使用感想:
只有赞而已
可以把你要的步骤 (包括影像的前处理) 全部写在一个 pipline 里
可针对特定的实验写特定的 pipline
网站上也有许多实例可以下载参考
本着作依据 Creative Commons 姓名标示-非商业性-相同方式分享 授权条款为授权
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/tw/
--
※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.109.235.155
1F:推 ThisIsNotKFC:感觉就是个专业软体XD 01/06 12:07
2F:→ vixen:跟ImageJ比起来如何? 借问一下是否可转生物版? 01/06 15:37
3F:→ jimmy0930:CellProfiler 比较偏向 high throughput 的实验使用 01/06 16:19
※ vixen:转录至看板 Biology 01/06 16:25
4F:推 Rplus:感觉很帅气的软体 01/06 18:54