※ 引述《sunev (Veritas)》之銘言： : ※ 引述《theory (真好人˙希爾瑞)》之銘言： : : 你可以去翻翻高中的書或是有機化學的書，分子內氫鍵發生在哪種 case 裡 : : 再來比對一下，應該不難發現好像沒有這樣的幾何架構下可以生成.. : : 有引力沒錯，但可能沒達到構成氫鍵 (如果你老師說有，那就算我記錯了～) : : 至於計算的方面，不知上方幾位大大用的方法及 basis set？ : 我是用dft 6-31G++(d,p) DFT 也是有很多種 functional 的.. 不過我想你應該是用 B3LYP :P (其實不用這個，反而大家會懷疑你為什麼用別的 XDXD) : 反正這分子這麼小 : 就算用上面那個basis set也是十幾分鐘就跑完optimization了 : 或許可以用大一點 basis set : 後來想想dft可能無法好好的估量氫鍵的效果 : 所以用相同的basis set改mp2又算了一次 : 結論沒變就是了 是阿....這分子真的很小.. : : 例如分子對稱性一高的時候，如果分子的基態是 triplet state.... : : 很多方法做出來的可能都會有問題 (single determinant 的方法..) : 嗯嗯...我有想到這件事 : 在前一篇文章有回了一下 : 不過真要做下去就不是玩玩了 : 所以就沒試 : 看到有板友在推文裡寫相關paper : 原來到2004年都還有人在考量這問題啊?? 我沒時間去看那些 paper..只覺得很有趣.. XDXD 草酸這種應該被研究到爛的分子 居然還有人在研究.. : : basis set 也是一點，不一定越大就越好.. : : (據說某個 basis set 做 opt 以不準著名..不過這是我聽來的 XD) : 是麼 : 我倒是沒聽過這件事 好像是 LanL2MB 或 LanL2DZ 吧（在某學長口試時聽口委說的） 聽說是做 OPT 非常不準 這怪 basis set 我聽都沒聽過，更別說用過了.. : : 而且面對草酸..哪知道他的 H 應該在哪個位置..圖畫一畫就丟進去 run 吧？ @@ : 我有選兩個initial geometry : 一個朝內一個朝外 : 看看能不能看出分子內氫鍵的影響 : 朝內的能量是低了一點 : 不過也很難一下子做出結論 所以我才說直接丟進去算就好了..不用傷這個腦筋.. :P : : 尤其像這種會翻轉的分子，σ 鍵及 π 鍵根本分不開.. : : 一大堆東西攪在一起，有看等於沒看 : 強者就是看得出東西來啊..... : 不過我不是強者 黑阿 我也不是強者 @@ : : 雖然不是完全對的，但是在很多時候可以安全使用，且讓你做一些定性的分析 : Lewis structure超威的啊 : 這可是在量子力學前就發展出來的東西 : 我們絕對欠Lewis一座諾貝爾獎 : 但這個題目有點tricky : 好像不完全落在安全使用的範圍內啊 因為這個分子的對稱性不算低 要讓 VB 安全使用，就要在對稱性 C1 時 沒有 degenerate state 的時候 --

※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.114.43.84