作者giveUstars (大城市的游牧民族)
看板CMU_CM43A
標題[用功] 多ㄊㄞˋ鏈等電點速攻
時間Mon Oct 5 20:33:19 2009
好像很多人在問這東西(汗)
這東西的算法如果要不求甚解
隨便亂算其實還蠻好算的
拿課本習題舉例吧
p.109 No.11 Glu-His-Trp-Ser-Gly-Leu-Arg-Pro-Gly
我們要先知道會影響 polypeptide 電性的東西有誰
其實就只有兩側的 N 端、C 端,酸性或鹼性的 side chain
所以我們只要把這幾個特殊傢伙抓出來(此時你必須把 20 胺基酸分類都背熟)
Glu-
His-Trp-Ser-Gly-Leu-
Arg-Pro-Gly
所以這條胚胎鏈中有五個地方會影響電性
分別查表得到 pK = 2.34、4.25、6.00、9.67、12.48
此時決定性的一個機歪步驟就是 我們把這條胚胎鏈扔進 pH=0 的極酸性溶液
好 扔進這麼酸的溶液裡面後這條胚胎鏈會幹嘛
不是會水解謝謝 是會扔 H 的扔不掉、會接 H 的接不完
所有的 amino side 都會以 NH3+ 的形式存在、
所有的 caboxyl三小都會以 COOH 的形式存在
故以這條胚胎鏈來說 扔進 pH=0 溶液後,
會帶三價正電(amino side、Arg + His side chain)
這時我們把剛剛查到的五個 pK 排排站
pH = 2.34 4.25 6.00 9.67 12.48
電性 = +3 +2 +1 +0 -1 -2
所以這題的所有問題是不是都秒殺了呢?
pI = (6.00+9.67)/2
至於為什麼可以這樣算?
請參照一開始的 HH 公式,利用共軛酸鹼對等濃度時 pK = pH 去想
好啦,到這邊為止,有沒有覺得給你星被盜帳號了呢?
其實我平常沒事無聊在宿舍最喜歡做的事情就是看書了,大家要好好努力啊!
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