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標 題[甲乙] 系統生物學期末考資訊
發信站華佗 (Tue Jan 5 23:33:26 2010)
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※ 本文轉錄自 [howiec] 信箱
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標題: test
時間: 2010/01/05 Tue 23:32:47
作者: howiec4u (小方) 看板: gbgstudy
標題: test
時間: Tue Jan 5 23:34:35 2010
1、
星期四上午十點十分到十二點安康305系統生物學期末考試請大家告訴大家。
2、
老師上課幾乎都是照本宣科唸每一份講義加上提了一些講義外的東西,每次的重點看看
講義標題大概就能知道在說什麼。
以下是組頭們整理的期中考後每次課堂內容大要和老師提到並強調的些概念,大家參考
看看,根據老師的說法這些東西和期末考應該是沒什麼關係,不過我們還是要稍微瞭解
一下到底這門課在幹什麼:
1.Systems Biology Approaches to Traditional Chinese Medicine Concept
of Systems Chinese Medicine
大家別被這一長串標題嚇到了,這堂課老師在講的就是他有提過他去教對岸的中國
大陸高等中醫藥院校教材編委會的演講內容,也是李教授曾跟學長姊特別演講說過
的中醫精氣神介紹,整學期最有意義的課程檔案就是它
http://tinyurl.com/ye7prbl (載點):
老師從佛家的空說起:
佛教經典在論述人生涅槃有提到成、住、壞、空四個階段,老師說的 "空" 跟
佛家的空其實不太一樣,不過老師堅持他的理解才是正確的
所有東西都是從無到有,從無極到太極,然後開始有了內外之分 (陰陽) ,而
萬事萬物最終的境界就是 Great Whole (天人合一) 。在這個三度空間加時間
所構成的四維世界裏面,道家的精、氣、神三者是溝通我們和宇宙事物之間的
媒介,指導精氣神存在的東西就是道:道的特性是可藉由改變以及轉化這兩個
方式當作它的傳遞路徑。總之就是說了許多李氏佛道的東西。老師特別提到,
我們所在世界的構成物是空間和時間,時間是相對的,空間無相對性,空間中
兩大基礎構成分別是Material空間內的物體&Substance物質之基本構成粒子。
接著老師開始介紹經絡,經絡它可能是用光子在傳,傳遞媒介是結締組織。李
教授是電子顯微鏡專家,他觀察許多患者病理切片,發現穴位附近的結締組織
以及微神經叢都有密集的群聚,老師認為這不是偶然。根據老師的研究和猜想
所謂的經絡通路,是走在筋膜 (fascia) 之間的。
最後老師叫我們去練氣功。
2.Darwinian (Evolutionary) Medicine: An Universal Darwinism of Disease
今年是達爾文先生兩百歲生日。兩百多年來達爾文的學說在社會學和生物學等不同
學界都有很深遠的影響。達爾文的思想在現代應用最廣的就是他的Evolutionary,
而他理論是源於拉馬克先生的天擇論,天擇論被達爾文所闡釋補充然後再推演出了
進化觀。老師認為拉馬克用進廢退論沒什麼重大的意義,反而是他的天擇影響後世
較深。李教授花很多時間在講達爾文先生的生平。達爾文的進化演化觀應用到醫學
上就是癌症的病理發生,以前無癌症等病理狀態,但隨著時代演進,人體病理發生
產生越來越多的文明病和匪夷所思的症狀,這些都是醫學的挑戰。老師認為
天擇讓
人們更容易受到疾病的感染(並要我們回家思考為什麼),隨著越來越多的病原體,
大家體認到撲殺它們是殺不完的,那我們就用調整身體狀態的方式,使得身體機能
回復到未生病前的樣子,就算病原體不知道,我們照樣能夠處理病理狀態。對付疾
病要用多項指標而非單一指標。要有宏觀的概念。
問:為啥要系統生物學的方式去面對疾病?
答:基於系統生物的方式可以讓我們可以對疾病網路的詳細機制有更完整的了解,
也可使我們瞭解疾病病程以及擾亂到的網路。我們可因了解這些而發展出更好
的藥物、診斷方法、治療,或甚至提早預防。
老師說系統生物學英文是
Systems Biology,別忘了那個
s。
3.Advanced Systems Biology Approaches to Integromics (Multiomics)
一開始老師秀了三張長庚醫療體系蛋白質體計劃暨基因體計劃簽呈,還有四張剪報
然後開始介紹
-omics體學,體學包了含Proteomics蛋白質體學和Genomics基因體學
等。在基因體定序計畫後,我們要用更宏觀的角度來看那些眼睛所看不到的東西,
基因體定序讓我們瞭解最基本的核酸排列等,但是我們要知道除了有物質的組成外
物質的運作也是很重要的一環,而那些微物質的功能運作就是
體學在深入探討的東
西,後基因時代的科技脈動就是研究
體學。老師還提到也許未來可發展出電子細胞
這樣我們就能藉此做實驗不用再去培養細胞。
4.5.
Practical Applications of Systems Biology (I): Genetic Network of a Disease
Practical Applications of Systems Biology (II): A Systematic Look at an Old
Problem of Human Aging
老師提到以往的基因研究都是一個一個基因
(釣魚)而現在可一次研究許多
(基因組)
(網魚),傳統的基因研究讓我們了解基因位置與疾病的關係,現在我們用 Genome-
Wide Association可以了解到基因的差別與疾病的關係,同時也可以了解疾病狀況
和基因變異的原因。基因的變異會對疾病以及基因表現有直接的影響,透過基因體
研究,我們可以從許多個變異的基因中找到對疾病有獨立影響的基因。此外,透過
基因組研究我們也可以對於疾病的來龍去脈有更多的了解。
李教授認為中醫對於病程有比較深的體會,不像西醫現在還是比較常一個藥吃到好
不懂辨證辨病。基因組研究可以使我們透過了解整個基因如何驅使疾病的發展,即
可以說明疾病為何有如此多的複雜特徵。
疾病的機制會因基因表現的不同而有所不同,而基因表現又會因基因不同而有所不
同,這三者是互相影響的。當要研究一個疾病,我們若對於疾病的普遍特性做觀察
,與其普遍特性的基因相關的、又呈現混亂的,就很有可能與此疾病成高度相關。
老師提到未來可能可以做到分析你的基因,告知你可能得什麼病的機率是多少、什
麼時候比較可能得、要怎麼吃比較好,甚至做什麼運動最適合等。
標題的OLD是一語雙關。
6.The Full Cycle of Translational and Reverse Translational Research in
Biomedical Science
之所以會有Translational research的出現,是為了解決以往基礎醫學與臨床醫學
各說各話而無交集。在以往,基礎醫學的研究往往無法落實到臨床上而造成浪費,
而臨床的醫學研究也往往無法與基礎學科溝通,這個溝通的鴻溝被稱為死亡之谷。
老師在這邊提到說為了使臨床醫師回來做研究,他還特別請醫院給予補助,讓每位
臨床醫師一個月有十八萬元津貼補貼少看門診之報酬。長庚可以這樣做,李教授到
中國醫藥學店推動的時候就沒辦法,校董群不給經費只想要便宜人力。李教授擔任
研發長和執行長時整頓學校教師讓醫學院和中醫學院
不會做研究的老師走人這也就
是為什麼像呂明進教授這類的超強SCI兼專利製造機加臨床一流可是教學X流的老師
會充斥校園。因為會教書的老師若不會研究,是待不下去的。當然這還牽涉到派系
人馬的問題,不過這又是另一個故事了。
題外話,滄哥說現在義守挖走的老師都非一流教師,長庚那邊也有一批老師回來,
所以我們這邊的中醫師資十年內還是算最優的。
另外,我們如果要找實驗對象,現在美國已有一種省思即是我們何不用人來做實驗
一來可避免動物的大量屠殺,二來也比較精確
人體可能會發生很多預料外的反應。
但要用人來做實驗,必須先向醫學倫理委員會申請才可以。
老師提到中醫是一種從 bedside 到 bench 的醫學
(臨床到實驗) 而西醫則是一種
bench 到 bedside 的醫學,前者為 reversed translational research 後者則為
translational research。
最後老師提了兩個例子在這堂課,第一個是有國外醫學中心發展出一種藥,發現對
肺癌極為有效,然而到了歐美其他地區卻都沒有效,最後傳到東亞來,東亞的人用
這種藥卻極為有效,研究結果顯示,由於東亞人肺癌EGFR基因突變較多,可能導致
其與此藥較容易結合而產生效果,而歐美人基因突變得較少,所以對此藥反而無效
故現在要用此藥都要先經過基因檢測。另外值得一提的是,在腫瘤細胞裡面正常的
上皮細胞也有基因突變,只是比腫瘤細胞少。以後可能依基因突變的多寡來決定是
否要切除該組織。現在是外科手術時先切一公分送去病理檢驗,若有癌細胞再切一
公分再送去檢驗直到該部位完全沒有癌細胞出現。
第二個例子是關於基因治療,美國曾因這個基因治療失敗而使基因治療停了好幾年
這個案例是IL2RG gene這個基因因免疫不全,會讓人很多地方都會起水泡,又叫做
Bubble Boy Disease,於是科學家就想用病毒把正常的基因帶進去骨髓裡讓它分化
預先設想基因應該是隨機插入的,然而,卻因為帶進去的基因會傾向於引發癌症,
所以反而造成了21名實驗兒童有5名產生白血病而死亡。
我們的上課老師名字叫做李英雄,煩請大家不要忘記
李教授簡歷:台北市人,住敦化北路,1969年台大醫學系畢業
國立台灣大學醫學院兼任講師
國立台灣大學醫學院講師
台北醫學大學兼任教授
中原大學兼任副教授
長庚大學醫學院教授
長庚大學醫學院臨床醫學研究所所長
長庚大學醫學院院長
中國科學院,北京電子顯微鏡室客座教授及研究員
中國醫科大學客座教授
北京大學客座教授
北京醫科大學客座教授
上海醫科大學客座教授
福建醫科大學客座教授
揚州大學客座教授
成都中醫藥大學客座教授
長庚紀念醫院心臟血管內科系主任
長庚紀念醫院副院長
長庚中醫藥體系執行長
長庚研究發展委員會主席
佛教慈濟綜合醫院新店分院院長
亞洲大學生物科技學系講座教授
中國醫藥大學暨附設醫院顧問
中國醫藥大學醫學系專任講座教授
中國醫藥大學中醫學系兼任教授
中國醫藥大學醫療體系執行長
中國醫藥大學研發長
中國醫藥大學副校長
王永慶家庭醫師、陳立夫中西醫顧問群
有任何問題請洽甲班宗穎
乙班小方
系統生物學組頭群火哥暨小方下台一鞠躬。謝謝大家一同陪伴渡過這個莫名的一堂課
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