作者abeautiii (小燕子)
看板Biotech
標題[求救] paper問題 拜託幫忙
時間Mon May 6 14:47:01 2024
各位先進好,有一些paper問題想請教
Paper標題:Tissue-resident memory CAR T cells with stem-like characteristics d
isplay enhanced efficacy against solid and liquid tumors
連結:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10313923/
主要是圖看不太懂,很多圖都是第一次看到,雖然上網查了很多資料,但還是對於paper
圖的意義不理解
像Fig.1 的圖A
https://i.imgur.com/yXsTY0p.jpeg
Flow的等高線圖越密集應該是代表表現量越高吧,CAR-TRM右上(+,+)和左下(-,-)表現差
不多,這是代表什麼意思?
Fig.6的圖I
https://i.imgur.com/MXm8Yuq.jpeg
這種圖要怎麼看,CAR-TRM在有無CD103的情況下的表現,框框代表什麼,在框框內外是什
麼意思?沒有查到y軸的SSH-H是什麼?
Fig.2的圖A
https://i.imgur.com/lzqAQIa.jpeg
第一次看到PCA圖,查的資料都是這是將資料降維,有三種主成份,但還是不懂點的遠近
跟位置代表什麼意思
Fig.3的圖A和Fig.S4的圖B
https://i.imgur.com/Qa7z1Wr.jpeg
https://i.imgur.com/OxRiPcG.jpeg
也是第一次看到UMAP圖,查到是相似的會聚集在一起?Fig.3這是收集細胞後擴增,利用s
cRNA-seq處理,再進行聚類分析,第一張是可以看出三種標記的表現量比較,點的數量就
代表表現量嗎?第二張圖的紅點較多代表什麼意思,CAR-TRM的擴增較多?第三張完全看
不懂,這是代表細胞主要在哪個階段嗎?是CAR-Tconv還是CAR-TRM,這樣也看不出量多寡
,點的位置有意義嗎?
Fig.S4點的數量是表現量嗎?這樣是MKI67表現較多?還是要對照點分佈的位置一起看?
拜託各位先進幫忙,可能很多笨問題,但真的研究很久還是不懂,謝謝您們!
如果內容太多,留言不太方便,可以站內信,謝謝!
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1F:→ memory0907: 個人覺得,如果沒有flow cytometry和scRNAseq的概念,05/06 15:22
2F:→ memory0907: 實在很難用文字描述到讓你明白…05/06 15:22
3F:→ xxtomnyxx: 大學?碩士?學科背景?有多少相關技術知識? 05/06 21:04
4F:→ xxtomnyxx: 這些圖都算簡單的了,就算是第一次看也該能理解才對,05/06 21:05
5F:→ xxtomnyxx: 現在 Cell 和 Nature 上盡是些奇葩分析的奇葩圖表,那05/06 21:05
6F:→ xxtomnyxx: 些真的有夠難理解的。05/06 21:06
7F:→ xxtomnyxx: 然後常常在版上看到這類詢問知識還想請人手把手教的文05/06 21:06
8F:→ xxtomnyxx: ,對於專業知識被如此廉價的看待感到很無奈05/06 21:07
9F:→ xxtomnyxx: 要給建議的話,我會說:你會看不懂是因為你的理解幾乎 05/06 21:43
10F:→ xxtomnyxx: 都錯了,請搭配文章內文的描述,去推測這張圖要怎麼解 05/06 21:43
11F:→ xxtomnyxx: 讀會符合文章想表達的意思 05/06 21:44
12F:→ abeautiii: 已解惑,謝謝 05/07 13:00
※ 編輯: abeautiii (223.137.140.21 臺灣), 05/07/2024 13:00:55
13F:推 surgeon999: 3F 兇哦 05/11 13:11