作者fishg1216 (葉綠體)
看板Biotech
標題[討論] Sanger sequencing signal 判讀
時間Thu Dec 9 23:29:02 2021
大家好!
日前送了8個sample(6個同合子、2個異合子)送定序,每個sample頭尾都各定一條。
藉此測試設計的引子是否可區別SNP同異合子。
同合子皆符合預期結果,但兩個異合子(C/T)反股定序結果(ab1檔)發現
SNP位點上有兩個並列的小peak;正股定序沒有該狀況。
這是否代表reverse primer在專一性設計上有問題?
https://i.imgur.com/0O9SNGy.jpg
謝謝!
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 203.77.34.142 (臺灣)
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※ 編輯: fishg1216 (203.77.34.142 臺灣), 12/09/2021 23:39:46
1F:→ blence: 反股定序看得到heterozygous,正股看不到,不是正股有問題? 12/10 00:12
2F:推 mina31011: 我的想法跟樓上一樣 是正股有問題吧? 12/10 01:05
3F:→ xxtomnyxx: 我看懂你實驗的描述,所以無法回答... 12/10 06:24
4F:→ xxtomnyxx: 看不懂 12/10 06:24