作者spongeJa (化學最帥)
看板Biotech
標題[求救] 請問有人會使用Image J來自動數細胞嗎?
時間Sat Apr 25 00:51:07 2020
如題,
最近被丟了兩大疊加藥後的細胞照片
想用Image J來自動計數細胞(比較有效率)
但附近的人都沒有人會使用
有爬文看教程,但實際操作起來就是很怪
沒辦法像學長一個一個慢慢點出來的數量一樣正確
(他點900多,我用Image J跑出來600多)
不知道是不是因為沒有用顯微鏡去拍照
導致畫面不平整、細胞沒辦法完整呈現出來
拜託各位大神救援一下QQ
(這是其中一盤的照片)
https://i.imgur.com/ALF1krs.jpg
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 115.43.81.76 (臺灣)
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※ 編輯: spongeJa (115.43.81.76 臺灣), 04/25/2020 12:11:50
2F:→ how20: 之用過CFU. AI 數,不過沒有很準,很多誤差,不過用來估算 04/27 01:18
3F:→ how20: 還可以。沒有用過image J算過,試試調一下對比會不會準一點 04/27 01:18
4F:→ how20: ? 04/27 01:18
5F:推 BJ1014: 之前用過 我記得google一下就有教學了... 05/04 16:45
6F:推 mango1986: 以前用image j數過很不準,就放棄了 05/06 10:15
7F:→ hermitwhite: 我覺得影像不夠清晰(對焦不準或設備分辨率低)是個 05/06 12:43
8F:→ hermitwhite: 可以改善的地方,但這種大小不均還會重疊的本來就不 05/06 12:43
9F:→ hermitwhite: 適合ImageJ,可以改用OpenCFU看看。 05/06 12:44
10F:推 vagus0620: 有重疊的imageJ會判定成一點,這樣不準 06/14 13:02
11F:推 MartianIT: 可以用watershed分離重疊的colonies 會有幫助 06/15 19:08