作者bridge850108 (bridgez)
看板Biotech
標題[求救] 數個實驗圖表請教
時間Sun Dec 10 15:34:27 2017
大家好邊緣人專討讀論文有幾個問題想請教
出處
https://bmcplantbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12870-017-1175-3
新增問題的論文出處
https://tinyurl.com/y92rvuem
不好意思我得再問一個問題
https://imgur.com/0wU99Sg
這個圖大概是在講AtMPC1會和NRGA1形成蛋白質複合體(丙酮酸運輸蛋白)
因此都存在時才有辦法回復缺失mpc1~3突變株的生長狀況(除了mpc1株只需AtMPC1)
請問為什麼用YPAD和SC-Ura-Leu plate培養酵母呢?
我只能大概猜測是缺乏營養之類的
但是不能理解YPAD與SC-Ura-Leu plate及酵母菌及突變株的關係
煩請解答 感謝!
問題一
主要是講位於植物粒線體上的運輸蛋白mpc1
其功能是將pyruvate從細胞質運輸到粒線體
首先用四種基因型的阿拉伯芥做實驗
col-0 (Wild Type)
mpc1 (T-DNA插入WT序列中，導致WT的AtMPC1基因不表達)
OE lines (利用cDNA過表達AtMPC1)
Complementation lines(C lines)(將AtMPC1用cDNA轉入mpc1株)
我有問題的是C lines
實驗結果C lines幾乎都跟WT一樣
請問這種特地把基因轉入不表達株造成與WT相似的結果有什麼目的呢?
問題二
https://imgur.com/PWoeCc7
我不知道該如何讀這張圖表
這是利用patch clamp檢測細胞膜上陰離子通道(s-type)的流量
ABA會導致流量增加
請問為何左圖的電流每一塊都有那麼多條線?
請問為何要特地做出右圖這種圖表，我以為有左圖就可以表達流量增加了?
大恩大德
感激不盡
我真的不知道可以找誰問了QQ
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1F：推 kikko1805: 一就是確定mutant和WT不一樣是因為這個基因不見，而不 12/10 16:09
2F：→ kikko1805: 是因為其他因素造成的，因為當我把這個基因弄回來之後( 12/10 16:09
3F：→ kikko1805: C lines)就復原了 12/10 16:09
4F：→ kikko1805: 二交給樓下 12/10 16:10
5F：→ bridge850108: 謝謝 12/10 16:14
6F：推 kikko1805: 喔雖然a圖原理我看不懂不過b圖就是把a圖的4個line畫在 12/10 16:14
7F：→ kikko1805: 同一個圖表上以利比較 12/10 16:14
8F：推 joseph103331: 左圖是利用不同Voltage收固定時間畫出來的圖 12/10 17:26
9F：→ joseph103331: 右邊則是每組的voltage vs pA的結果圖 12/10 17:27
10F：→ joseph103331: 左邊每條線對應右邊的一個點 12/10 17:28
11F：→ joseph103331: Ref6 Science那篇的Fig有比較詳細的解釋 12/10 17:29
12F：→ bridge850108: 非常非常感謝兩位Q_Q 12/10 17:36
※ 編輯: bridge850108 (218.166.34.201), 12/11/2017 00:43:18
※ 編輯: bridge850108 (218.166.34.201), 12/11/2017 00:46:21
13F：推 joseph103331: 新的問題應該跟代謝路徑有關，查查看TCA cycle跟蛋 12/11 04:37
14F：→ joseph103331: 白質生合成之間的關係 12/11 04:37
15F：→ Ianthegood: YPD是很肥的標準medium SC是合成的defined medium 12/11 06:29
16F：→ Ianthegood: 突變株掛掉某個pathway之後 缺乏某幾個aa就會讓合成的 12/11 06:30
17F：→ Ianthegood: 下游走不下去 就會長不出來 12/11 06:30
18F：→ Ianthegood: 確認掛掉的gene跟這個pathway真的有關 12/11 06:31
19F：→ bridge850108: 非常感謝！ 12/11 10:58
20F：推 july81212: -Ura是因為跟用來篩vector 12/12 02:22
21F：推 july81212: leu的生成需要pyruvate 所以-Lue用來檢驗carriers 的 12/12 02:25
22F：→ july81212: 能力 12/12 02:26
23F：→ bridge850108: 謝謝！ 12/12 09:03