作者champ12 (champion)
看板Biotech
標題[求救] 請教MaxQuant裡的參數設定
時間Thu May 25 10:44:08 2017
大家好
我將sample送到中研院打Mass spec
使用的機台為Orbitrap velos
拿到sample後我使用MaxQuant進行protein ID
之後會再用Skyline進行定量
目前遇到的問題是在Instrument的參數設定上
雖然MaxQuant對Orbitrap系列的機台已經有預設的設定
但對於每個參數的意義實在一知半解
懇求非常了解ms/ms的大大為我解答
這是參數頁面的截圖
http://i.imgur.com/O4ikPSi.jpg
真的萬分感謝QQQQ 救救想畢業的女子QQ
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 223.140.52.7
※ 文章網址: https://webptt.com/m.aspx?n=bbs/Biotech/M.1495680250.A.8D9.html
1F：推 biingru: 我也不懂這個機器05/25 10:54
2F：→ biingru: 但是我遇到這個問題我會先google他的操作手冊來看05/25 10:55
3F：→ biingru: 訓練自己獨立解決問題05/25 10:56
你好，因為這個軟體的網頁幾乎沒有敘述，在找過數篇與這個軟體相關的paper後 (也看
了youtube與一些國外上課的講義) 還是沒辦法解決這些參數的設置，所以才決定上來請
教大家><
※ 編輯: champ12 (223.140.52.7), 05/25/2017 11:03:11
4F：推 lelojack: 機器沒有敘述代表這是專有名詞，請去找定義; 如果連定 05/26 06:42
5F：→ lelojack: 義都不清楚，代表你的背景不足，就我的經驗是一般是缺 05/26 06:42
6F：→ lelojack: 數學及統計的基礎 05/26 06:42
7F：推 Ianthegood: 我不太懂的是 假設你是自己做wet lab 你只是要protei 05/26 06:47
8F：→ Ianthegood: n id 幹嘛需要這些參數? 明明論文裡一句中研院質譜服 05/26 06:47
9F：→ Ianthegood: 務結果就可以解決XD 05/26 06:47
11F：→ july81212: MPI summer camp youtube有檔先看完吧…… 06/01 20:27
12F：推 grazzilybear: 你需要瞭解什麼可以站內信問我，會的我儘量解答。針 06/17 14:06
13F：→ grazzilybear: 對定量MQ已經可以提供好的定量結果不需要再使用skyl 06/17 14:06
14F：→ grazzilybear: ine 06/17 14:06